TP53 Pro72等位基因在印度口腔舌癌中富集并在食管癌中频繁突变

该数据集来自 plos.figshare.com,配套 2014 年发表于 PLoS ONE 的研究,聚焦印度人群中 TP53 Pro72Arg 多态性与口腔舌鳞状细胞癌(SCCOT)及食管鳞状细胞癌(ESCC)的关联

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2023-05-31 更新
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基因组分类SCCOT patientsprotein functiongermline polymorphismsinfluence riskESCC patientsTP 53 Pro 72Arg polymorphismcell carcinomaPro 72Arg studyp 53 polymorphismTP 53 Pro 72 AlleleIndia PurposeThe tumor suppressor p 53Esophageal cancer
TP53 Pro72 Allele Is Enriched in Oral Tongue Cancer and Frequently Mutated in Esophageal Cancer in India

基本信息

模态
基因组
大小
0.003308059 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-31
版本
v1

资源简介

TP53 Pro72等位基因在印度口腔舌癌中富集并在食管癌中频繁突变

TP53 Pro72 Allele Is Enriched in Oral Tongue Cancer and Frequently Mutated in Esophageal Cancer in India

该数据集来自 plos.figshare.com,配套 2014 年发表于 PLoS ONE 的研究,聚焦印度人群中 TP53 Pro72Arg 多态性与口腔舌鳞状细胞癌(SCCOT)及食管鳞状细胞癌(ESCC)的关联。研究比较了 115 例 SCCOT 患者、82 例 ESCC 患者与 110 例健康对照的多态性分布,并分析其与临床病理及分子参数的关系。数据包含 8 个补充文件(图、表与文档),可用于探索 TP53 生殖系变异与癌症易感性的关联(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《TP53 Pro72 Allele Is Enriched in Oral Tongue Cancer and Frequently Mutated in Esophageal Cancer in India》发表于 PLoS ONE(2014),DOI:10.1371/journal.pone.0114002。源站首次发布:2014-12-01。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的 已知肿瘤抑制因子 p53 在多种癌症中频繁失活。此外,已知 TP53 的生殖系多态性会影响蛋白质功能并影响不同癌症类型的发生风险。在本研究中,我们分析了印度口腔舌鳞状细胞癌(SCCOT)和食管鳞状细胞癌(ESCC)中 TP53 Pro72Arg 多态性的关联。方法 我们评估了 115 例 SCCOT 和 82 例 ESCC 患者中 TP53 Pro72Arg 多态性的分布,并与来自同一人群的 110 例健康对照进行比较。此外,我们分析了该多态性与若干临床病理和分子参数的关联。结果 与健康对照组相比,Pro72 等位基因在 SCCOT 患者中显著富集,但在 ESCC 中两个等位基因均未富集。有趣的是,Pro72 a

【数据结构与技术规格】

文件数 8 个,合计 3.31 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0114002。

【主题与分类】

源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:SCCOT patients、protein function、germline polymorphisms、influence risk、ESCC patients、TP 53 Pro 72Arg polymorphism、cell carcinoma、Pro 72Arg study、p 53 polymorphism、TP 53 Pro 72 Allele。本站分类:肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biological Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_TP53_Pro72_Allele_Is_Enriched_in_Oral_Tongue_Cancer_and_Frequently_Mutated_in_Esophageal_Cancer_in_India/1255550

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:S. R. Adduri, Raju; Katamoni, Rajender; Pandilla, Ramaswamy; N. Madana, Sandeep; Kumar Paripati, Arun; Kotapalli, Viswakalyan; et al. (2016). TP53 Pro72 Allele Is Enriched in Oral Tongue Cancer and Frequently Mutated in Esophageal Cancer in India. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "Table_S3.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/1811185"
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文件清单

  • Figure_S1.eps(2.92 MB)
  • Table_S1.docx(53.12 KB)
  • Table_S2.doc(48.64 KB)
  • Table_S3.docx(48.73 KB)
  • Table_S4.doc(160.77 KB)
  • Table_S5.docx(36.02 KB)
  • Document_S1.docx(19.63 KB)
  • Document_S2.docx(19.52 KB)

文件总体积 3.31 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

目的
已知肿瘤抑制因子p53在多种癌症中频繁失活。此外,已知TP53的种系多态性会影响蛋白质功能,并影响不同癌症类型的发生风险。本研究分析了印度口腔舌鳞状细胞癌(SCCOT)和食管鳞状细胞癌(ESCC)中TP53 Pro72Arg多态性与疾病的关联。方法
我们分别评估了115例SCCOT患者和82例ESCC患者中TP53 Pro72Arg多态性的分布,并与来自同一人群的110名健康对照进行比较。此外,我们还分析了该多态性与若干临床病理及分子参数的关联。结果
与健康对照组相比,Pro72等位基因在SCCOT患者中显著富集,但在ESCC中两个等位基因均未富集。有趣的是,Pro72等位基因在ESCC中优先发生突变,这一点通过对Pro72Arg杂合样本的分析得到了证实。结论
我们的研究揭示了Pro72等位基因与SCCOT的关联,提示该多态性对SCCOT风险的影响。

Pro72等位基因在食管鳞状细胞癌中的优先突变表明,需要进一步研究以理解p53多态性的组织特异性效应。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0114002(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_TP53_Pro72_Allele_Is_Enriched_in_Oral_Tongue_Cancer_and_Frequently_Mutated_in_Esophageal_Cancer_in_India/1255550)。

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