ST003092：利用基因组规模代谢模型和突变数据预测癌症体细胞突变相关代谢物

资源简介

ST003092：利用基因组规模代谢模型和突变数据预测癌症体细胞突变相关代谢物

ST003092 是一个以癌症代谢物预测为主题的数据集，英文全称为“Prediction of metabolites associated with somatic mutations in cancers by using genome-scale metabolic models and mutation data”。该数据集收录于 metabolomicsworkbench.org，在分类上归属于肿瘤 / 其他方向，主题标签为 CE-MS。从整体定位来看，它围绕利用基因组规模代谢模型与突变数据预测癌症中与体细胞突变相关的代谢物这一研究目标展开，属于代谢组学与肿瘤基因组信息交叉的研究资源。源站将其描述为一项代谢组学研究，采用 CE-MS 技术，研究物种为 Homo sapiens，来源机构为韩国科学技术院（Korea Advanced Institute of Science and Technology，KAIST）。该数据集适合关注肿瘤代谢重编程、体细胞突变与代谢物关联以及代谢模型预测方法的研究人员参考使用。

【数据集背景】

该数据集的研究背景建立在肿瘤代谢与基因组突变之间的关联分析之上。癌症的发生发展往往伴随体细胞突变，而这些突变可能通过影响代谢通路中的酶或调控环节，进一步改变细胞内代谢物的水平。传统代谢组学实验能够检测样本中的代谢物，但若要系统性地将特定体细胞突变与代谢物变化建立联系，则需要借助基因组规模代谢模型与突变数据进行计算预测。ST003092 正是围绕这一思路形成的数据资源，其英文名称明确指向“利用基因组规模代谢模型和突变数据预测癌症中与体细胞突变相关的代谢物”。该数据集在来源站被归类为肿瘤 / 其他，主题标签为 CE-MS，说明其与代谢组学检测技术存在直接关联。源站描述还指出，该研究属于代谢组学研究，物种为 Homo sapiens，来源机构为韩国科学技术院（KAIST）。这些信息共同构成了该数据集的基本背景，即面向人类癌症，结合代谢模型、突变数据与代谢组学检测手段，探索体细胞突变相关代谢物的预测问题。

【数据内容】

该数据集的核心内容与“预测癌症中与体细胞突变相关的代谢物”这一主题相关。其英文名称表明，研究涉及基因组规模代谢模型和突变数据两类信息，并以此预测与体细胞突变相关的代谢物。主题标签为 CE-MS，说明该数据集在代谢物检测层面采用毛细管电泳-质谱联用技术。源站描述将其界定为一项代谢组学研究，研究物种为 Homo sapiens。除上述信息外，关于数据集内具体包含多少样本、多少代谢物、多少突变记录、文件格式、字段结构、数据规模等细节，源站未提供。因此，无法进一步说明其具体数据表、矩阵内容或注释信息。整体而言，该数据集的内容定位是肿瘤代谢组学与突变关联预测研究的组成部分，而非单纯的原始代谢物峰表或突变列表。

【采集与来源】

该数据集来源于 metabolomicsworkbench.org，源站描述显示其研究类型为代谢组学研究，检测技术为 CE-MS，研究物种为 Homo sapiens，来源机构为韩国科学技术院（Korea Advanced Institute of Science and Technology，KAIST）。这些信息说明该数据集具有明确的机构来源和物种背景，并以毛细管电泳-质谱联用作为代谢组学检测手段。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、样本量、受试者特征、细胞系或组织类型、实验设计细节、仪器型号、分离条件、质谱参数等，源站未提供。因此，在采集与来源方面，只能确认其来自 metabolomicsworkbench.org，并由 KAIST 相关研究产生，采用 CE-MS 技术，研究对象为人类。

【适用场景】

该数据集适用于与肿瘤代谢组学和突变相关代谢物预测有关的研究场景。具体而言，可服务于以下方向：利用基因组规模代谢模型与突变数据探索癌症中体细胞突变与代谢物之间的关联；结合 CE-MS 代谢组学数据开展方法验证或比较；在人类肿瘤代谢重编程研究中作为参考数据资源；以及用于代谢组学与癌症基因组信息整合分析的教学或方法开发。由于主题标签为 CE-MS，该数据集也可能适合对毛细管电泳-质谱联用技术感兴趣的代谢组学研究人员。需要说明的是，以上适用场景基于该数据集的名称、分类、主题标签和源站描述进行合理组织，源站未提供具体的推荐使用场景、任务类型或基准评测信息。

【使用方法】

关于该数据集的具体使用方法，源站未提供。无法确认其数据下载方式、文件组织方式、预处理流程、分析工具、模型输入输出格式、代码示例或配套文档。若使用者希望利用该数据集开展研究，需要依据 metabolomicsworkbench.org 上该数据集的原始页面获取进一步说明。由于源站描述仅包含研究类型、物种、机构和 CE-MS 等信息，未涉及使用步骤或分析流程，因此无法在本介绍中给出具体操作指南。

【质量与限制】

该数据集的质量与限制信息，源站未提供。无法确认其数据完整性、重复性、缺失值比例、归一化方法、质控样本信息、批次效应处理、代谢物鉴定置信度、突变数据来源与版本、模型覆盖范围等。已知信息仅包括：数据集英文名称、所属分类为肿瘤 / 其他、来源站为 metabolomicsworkbench.org、源站描述为代谢组学研究（CE-MS）、物种为 Homo sapiens、机构为 KAIST、主题标签为 CE-MS。基于这些有限信息，无法对其质量水平或使用限制做出进一步判断。使用者在参考该数据集时，应直接查阅源站页面以了解其质量控制、数据范围与潜在限制。

【引用与许可】

该数据集的引用方式与许可信息，源站未提供。无法确认其授权协议、使用条款、是否允许再分发、是否要求署名、是否限制商业用途，也无法确认其推荐引用格式、DOI、论文出处或贡献者列表。由于来源站 metabolomicsworkbench.org 通常会在数据集页面提供相关引用和许可说明，建议使用者访问该数据集在源站的具体页面获取准确信息。在未获得明确许可信息之前，不应假定该数据集可以自由使用或再分发。