单细胞多组学与时空组学解析肝脏退行性疾病机制

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源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07265544

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数据说明

条件：肝脏肿瘤、HBV感染、非酒精性脂肪性肝病NAFLD、肝纤维化。研究目标 本研究的目的是利用临床科室的优势，从肝血管瘤、局灶性结节性增生、脂肪肝、HBV感染、肝纤维化和肝硬化患者中采集符合项目要求的术前外周血样本和肝组织（来自肝切除术或肝活检）。本计画旨在建立包含160-240例病例的大规模临床肝病样本库。该研究将涵盖不同年龄组（包括18岁以下未成年人、18-50岁成年人以及65岁以上老年人）的肝脏，以及不同严重程度的脂肪肝（轻度、中度、重度）、HBV感染和肝纤维化（早期、中度、晚期[肝硬化]）。利用单细胞多组学（如单细胞转录组学和染色质可及性测序）和空间组学测序技术，该研究将构建涵盖稳态、衰老、肝纤维化和脂肪肝状态的人类肝脏时空退变-再生图谱。

通过比较不同组别细胞群体的表型、功能、空间分布及细胞间相互作用，本研究旨在确定细胞治疗、基因治疗或其他干预措施的诊断和治疗靶点。研究期间，不会对参与者实施随机或方案驱动的治疗。如临床适宜，主治医师将根据个体情况做出决策并选择治疗方案。数据收集程序鉴于这是一项多中心、前瞻性、观察性研究，除常规临床实践外，无需额外的访视或实验室分析。医师将根据指示和当地指南确定治疗方案。研究人员将审查患者的病史和实验室报告，以根据纳入和排除标准确定资格。患者可

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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