生殖细胞癌细胞系整合全基因组表观遗传与表达谱分析识别的精原细胞瘤与胚胎性癌印记（甲基化数据）
该数据集来自 frontiersin.figshare.com，包含一份关于睾丸生殖细胞肿瘤（TGCT）mRNA预后标志物识别的表格文件，主题涉及预后标志物、风险因素、免疫细胞浸润、化疗耐药及竞争性内源RNA网络
基本信息
资源简介
生殖细胞癌细胞系整合全基因组表观遗传与表达谱分析识别的精原细胞瘤与胚胎性癌印记（甲基化数据）
Table_1_Identification of mRNA Prognostic Markers for TGCT by Integration of Co-Expression and CeRNA Network.xlsx
该数据集来自 frontiersin.figshare.com，包含一份关于睾丸生殖细胞肿瘤（TGCT）mRNA预后标志物识别的表格文件，主题涉及预后标志物、风险因素、免疫细胞浸润、化疗耐药及竞争性内源RNA网络。源站描述显示研究基于13例TGCT组织与4例癌旁正常组织的转录组测序，结合TCGA数据库构建转移与复发预测模型，并鉴定GRK4、PCYT2和RGSL1为生存与治疗反应的预测标志物。该数据可用于TGCT预后相关标志物分析与预测模型研究（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2021-09-21。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：睾丸生殖细胞肿瘤（TGCT）是年轻男性中最常见的恶性肿瘤，且与不良预后相关。我们通过转录组测序评估了13例TGCT组织和4例癌旁正常组织的RNA表达谱，以识别新的预后生物标志物。我们在TGCT中检测到若干差异表达mRNA，并通过GO和KEGG富集分析将其功能注释到免疫和化疗耐药等肿瘤发生相关过程。利用RNA-Seq数据和公共数据库构建了mRNA-lncRNA-miRNA调控网络，并与TCGA数据库整合，开发了转移和复发的预测模型。最终，GRK4、PCYT2和RGSL1被确定为生存和治疗反应的预测标志物。总之，我们通过ceRN
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 101.95 KB。数据集 DOI：10.3389/fendo.2021.743155.s001。
【主题与分类】
源站学科分类：Reproduction、Cell Metabolism、Endocrinology。主题标签：testicular germ cell tumors、prognostic markers、risk factor、immune cell infiltration、chemotherapy resistance、competitive endogenous RNAs network。本站分类：肿瘤。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Reproduction、Cell Metabolism、Endocrinology。
【获取与许可】
源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Identification_of_mRNA_Prognostic_Markers_for_TGCT_by_Integration_of_Co-Expression_and_CeRNA_Network_xlsx/16652551
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Zhu, Fang; Liu, Zhizhong; Zhou, Qianyin; Fan, Jingyu; Zhou, Dai; Xing, Liu; et al. (2021). Table_1_Identification of mRNA Prognostic Markers for TGCT by Integration of Co-Expression and CeRNA Network.xlsx. Frontiers. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-02，引用时请注意版本时效。
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Table_1_Identification of mRNA Prognostic Markers for TGCT by Integration of Co-Expression and CeRNA Network.xlsx
- DOI：10.3389/fendo.2021.743155.s001
- 发布日期：2021-09-21
- 文件数：1 个
- 文件总体积：101.95 KB
- 源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Identification_of_mRNA_Prognostic_Markers_for_TGCT_by_Integration_of_Co-Expression_and_CeRNA_Network_xlsx/16652551
命令行下载
curl -L -o "Table_1_Identification of mRNA Prognostic Markers for TGCT by Integration of Co-Expression and CeRNA Network.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/30834094"
文件清单
Table_1_Identification of mRNA Prognostic Markers for TGCT by Integration of Co-Expression and CeRNA Network.xlsx（101.95 KB）
文件总体积 101.95 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
睾丸生殖细胞肿瘤（TGCT）是年轻男性中最常见的恶性肿瘤，且预后较差。我们通过转录组测序评估了13例TGCT组织和4例癌旁正常组织的RNA表达谱，以识别新的预后生物标志物。我们在TGCT中检测到若干差异表达的mRNA，并通过GO和KEGG富集分析将其功能注释至免疫和化疗耐药等肿瘤发生相关过程。利用RNA-Seq数据和公共数据库构建了mRNA-lncRNA-miRNA调控网络，并与TCGA数据库整合，以建立转移和复发的预测模型。最终，GRK4、PCYT2和RGSL1被确定为生存和治疗反应的预测标志物。总之，我们通过ceRNA网络分析发现了若干潜在的TGCT预后和免疫治疗反应预测因子。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.3389/fendo.2021.743155.s001（source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Identification_of_mRNA_Prognostic_Markers_for_TGCT_by_Integration_of_Co-Expression_and_CeRNA_Network_xlsx/16652551）。
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