PRJNA860838：MCF7与MCF10A转录组对比Luminal A乳腺肿瘤
该数据集来自NCBI，包含对致瘤性MCF7与非致瘤性MCF10A的2D和3D培养物进行RNA-seq分析，并整合已发表数据，是首个在同一实验中涵盖MCF7和MCF10A的2D与3D培养的RNA-seq数据集
基本信息
资源简介
PRJNA860838：MCF7与MCF10A转录组对比Luminal A乳腺肿瘤
该数据集来自NCBI，包含对致瘤性MCF7与非致瘤性MCF10A的2D和3D培养物进行RNA-seq分析，并整合已发表数据，是首个在同一实验中涵盖MCF7和MCF10A的2D与3D培养的RNA-seq数据集。研究比较了细胞系内（MCF7对MCF10A）与TCGA-BRCA临床组织内（Luminal A对Normal）的肿瘤发生过程，以评估细胞系肿瘤建模效果。数据可用于基因表达谱比较分析、肿瘤建模有效性评估及癌症相关过程研究（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：为了更好地理解细胞系的肿瘤建模效果，我们对致瘤性MCF7和非致瘤性MCF10A的2D和3D培养物进行了RNA-seq分析，并用已发表的数据集进行了补充。据我们所知，这是首个在同一实验中包含MCF7和MCF10A的2D和3D培养物的RNA-seq数据集。然后，我们比较了细胞系内的肿瘤发生（MCF7对MCF10A）和来自TCGA-BRCA数据集的临床组织内的肿瘤发生（Luminal A对Normal），并考虑了是否能观察到相同的癌症相关过程。总体设计：对3D MCF10A、2D MCF10A、3D MCF7、2D MCF7进行比较基因表达谱分析。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptome or Gene expression。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA860838
下载信息
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数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA860838
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为更好地理解细胞系的肿瘤建模效果，我们对致瘤性MCF7和非致瘤性MCF10A的2D和3D培养物进行了RNA-seq分析，并用已发表的数据集扩充了我们的数据。据我们所知，这是首个在同一实验中包含MCF7和MCF10A的2D和3D培养物的RNA-seq数据集。随后，我们比较了细胞系内的肿瘤发生情况（MCF7对MCF10A）与TCGA-BRCA数据集中临床组织内的肿瘤发生情况（Luminal A对Normal），并考虑了是否能观察到相同的癌症相关过程。总体设计：针对3D MCF10A、2D MCF10A、3D MCF7、2D MCF7的比较基因表达谱分析。
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