PRJNA296359:细胞周期分选细胞中的基因表达特征 [HDFa_mRNA_array]

数据围绕细胞周期分选细胞的基因表达特征,属于转录组或基因表达类数据,可用于研究细胞周期不同阶段的表达差异及相关分析。源站未提供样本量、物种细节、平台信息与具体用途说明(来源 NCBI)

sra
浏览 5
基因组回归Transcriptome or Gene expression
PRJNA296359: Gene expression signatures in cell cycle sorted cells [HDFa_mRNA_array]

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

PRJNA296359:细胞周期分选细胞中的基因表达特征 [HDFa_mRNA_array]

该数据集为 PRJNA296359: Gene expression signatures in cell cycle sorted cells [HDFa_mRNA_array],来源于 NCBI 的 BioProject 数据库,主题标签为 Transcriptome or Gene expression。从名称和标签来看,数据围绕细胞周期分选细胞的基因表达特征展开,属于转录组或基因表达类数据,可用于研究细胞周期不同阶段的表达差异及相关分析。该数据集在分类上归入肿瘤 / 其他,提示其可能与肿瘤相关研究背景存在关联,但源站未提供样本量、物种细节、平台信息与具体用途说明。整体而言,这是一个以基因表达签名为核心的生物项目记录,旨在为细胞周期分选条件下的表达谱研究提供数据入口。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种项目记录形式,用于汇集与某一项研究计划相关的多种生物数据。该记录通常来自单一组织或联合体,并为用户提供一个统一入口,以便查找该项目所产生的不同类型数据。PRJNA296359 即属于此类项目记录,其标题明确指出研究对象为细胞周期分选细胞中的基因表达签名,并带有 HDFa_mRNA_array 标识。该数据集被归入肿瘤 / 其他类别,主题标签为 Transcriptome or Gene expression,说明其核心内容与转录组或基因表达相关。源站未提供该项目的具体研究背景、立项机构、研究目的或所属课题的详细说明。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression,表明其数据内容属于转录组或基因表达类型。数据集名称中包含“Gene expression signatures in cell cycle sorted cells”,说明数据围绕细胞周期分选细胞的基因表达特征展开,可能涉及对不同细胞周期阶段细胞进行分选后获得的表达谱信息。名称中的 HDFa_mRNA_array 提示该数据可能与 mRNA 阵列检测相关,但源站未提供样本量、物种细节、平台信息与具体用途说明。除上述信息外,源站未提供关于数据文件类型、数据量、基因数量、表达矩阵结构或分析结果的进一步描述。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站描述指出,BioProject 是相关生物数据的集合,这些数据与单一研究计划相关,来自单一组织或联合体,并为用户提供查找该项目所生成的不同类型数据的统一位置。该数据集的英文名称为 PRJNA296359: Gene expression signatures in cell cycle sorted cells [HDFa_mRNA_array],源站标题为 Homo sapiens (ID 296359) - BioProject - NCBI。源站未提供样本采集方法、实验设计、测序或阵列平台、数据处理流程以及具体采集时间等信息。

【适用场景】

根据主题标签和标题信息,该数据集适用于转录组或基因表达相关研究,尤其是围绕细胞周期分选细胞的基因表达特征分析。潜在应用包括研究细胞周期不同阶段的表达差异、探索细胞周期相关基因表达签名,以及在此基础上开展与肿瘤或其他生物学过程相关的分析。由于该数据集被归入肿瘤 / 其他类别,也可能为肿瘤研究中的细胞周期相关表达分析提供参考。然而,源站未提供样本量、物种细节、平台信息与具体用途说明,因此无法进一步明确其适用的具体研究场景、分析类型或可支持的结论范围。

【使用方法】

该数据集以 BioProject 记录形式提供,用户可通过 NCBI 的 BioProject 数据库访问该项目,并借助记录中的链接查找与该项目相关的不同类型数据。源站描述表明,BioProject 记录为用户提供一个统一位置,以便发现该项目生成的各种数据。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、预处理步骤或使用协议,源站未提供。用户如需使用该数据集,应依据 NCBI BioProject 页面上实际提供的链接和说明进行操作,但源站未提供进一步的使用方法细节。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject,属于项目记录层面的数据集合。源站未提供样本量、物种细节、平台信息与具体用途说明,因此无法评估其数据质量、覆盖度、重复性、批次效应或分析可靠性。该数据集被归入肿瘤 / 其他类别,主题标签为 Transcriptome or Gene expression,但源站未提供关于数据质量控制、标准化处理、验证结果或局限性的任何说明。使用者在解释和应用该数据集时,需注意上述信息的缺失,并应结合源站实际提供的数据内容进行判断。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库,源站标题为 Homo sapiens (ID 296359) - BioProject - NCBI,英文名称为 PRJNA296359: Gene expression signatures in cell cycle sorted cells [HDFa_mRNA_array]。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或版权声明,源站未提供。用户在使用该数据集时,应参考 NCBI BioProject 页面上的相关说明,并遵循 NCBI 的一般使用政策,但源站未提供具体的引用格式或授权条款。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA296359

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为了进一步研究细胞周期依赖性基因表达谱,对人工转化的癌细胞系和原代未转化成纤维细胞进行了基于DNA含量的荧光激活细胞分选(细胞周期分选)。对G1、S和G2期进行了阶段依赖性基因表达谱分析。结果通过定量实时PCR进行了验证。总体设计:对分选后的人类癌细胞(宫颈癌——HeLa和肾上腺皮质癌——NCI-H295R)及原代未转化成纤维细胞(HDFa)进行了阶段依赖性基因表达谱分析。成功分选并分析了G1、S和G2期。HDFa_mRNA数据集

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。