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创建/更新时间

2026-11-04

资源简介

癌症恶病质小鼠模型下丘脑食欲调节因子基因表达数据集 2

PRJNA188559: Hypothalamic gene expression of appetite regulators in a cancer-cachectic mouse model [Dataset 2] 是来源于 NCBI BioProject 数据库（项目 ID 188559）的一个小鼠转录组或基因表达数据集。该数据集围绕癌症恶病质小鼠模型展开，聚焦于下丘脑组织中食欲调节因子的基因表达情况。癌症恶病质是一种伴随恶性肿瘤出现的复杂代谢综合征，常表现为体重下降、食欲减退和肌肉消耗，而下丘脑作为中枢神经系统中调控摄食与能量平衡的关键区域，其基因表达变化对于理解恶病质状态下食欲调控机制具有重要意义。该数据集以 BioProject 形式组织，为用户提供访问相关生物学数据类型的统一入口，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，本站分类归入肿瘤 / 其他。

【数据集背景】

该数据集对应的 BioProject 记录来自 NCBI，项目编号为 188559，物种为 Mus musculus（小鼠）。BioProject 是围绕某一具体研究计划或倡议而组织起来的生物学数据集合，通常来源于单一机构或联盟。BioProject 记录的作用是为用户提供一个统一的位置，以便查找该项目所产生的多种数据类型及其相关链接。该数据集标题明确指出其研究内容为癌症恶病质小鼠模型下丘脑组织中食欲调节因子的基因表达，属于转录组或基因表达研究范畴。癌症恶病质涉及肿瘤与宿主之间的复杂相互作用，下丘脑在食欲和能量代谢调控中扮演核心角色，因此针对该区域基因表达的研究有助于揭示恶病质相关食欲失调的分子基础。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其数据内容属于转录组或基因表达类型。数据集标题中提及“Hypothalamic gene expression of appetite regulators”，说明数据涉及下丘脑组织中与食欲调节相关的基因表达信息。数据集名称中包含“[Dataset 2]”标识，提示其可能是一个更大项目中的第二个数据集。除上述信息外，关于具体基因列表、表达量数值、样本数量、测序平台或数据分析结果等详细内容，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录，项目 ID 为 188559，物种为小鼠（Mus musculus）。BioProject 记录本身是生物学数据的集合入口，来源于单一组织或联盟，并提供指向该项目所生成的不同数据类型及其链接的统一访问位置。关于样本采集的具体方法、实验设计、组织处理流程、测序或检测平台、时间地点等细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是围绕癌症恶病质小鼠模型下丘脑组织中食欲调节因子表达变化的研究。潜在应用包括：探索恶病质状态下中枢食欲调控的分子机制、比较不同条件下下丘脑基因表达差异、为相关代谢与肿瘤研究提供转录组层面的参考数据。由于该数据集属于 BioProject 组织框架，用户可通过该记录查找与之关联的多种数据类型。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该数据集，项目 ID 为 188559。BioProject 记录提供统一入口，用户可从中找到指向该项目所生成的不同数据类型及其相关链接。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、预处理步骤或使用协议，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公开的生物学数据项目记录。其主题标签为 Transcriptome or Gene expression，物种为小鼠，研究内容为癌症恶病质模型下丘脑食欲调节因子基因表达。关于数据质量评估指标、样本量、测序深度、数据完整性、潜在偏差或使用限制等信息，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI BioProject，项目 ID 为 188559，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的具体引用格式、许可条款、使用限制或授权信息，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE44081

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数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA188559

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

癌症患者的食欲常受影响，导致厌食，进而造成食物摄入不足。本研究报道了一种食物摄入量增加的癌症恶病质小鼠模型的下丘脑基因表达谱。在此模型中，携带C26结肠腺癌的小鼠在体重下降后食物摄入量增加。我们假设，在此模型中，下丘脑中显然在厌食时失效的食欲调节系统仍能充分适应能量平衡的变化。因此，研究下丘脑食欲调节因子发生的变化可能揭示治疗癌症所致进食障碍的靶点。通过应用转录组学，可以考虑到下丘脑中的许多食欲调节系统，从而提供肿瘤生长期间下丘脑所发生变化的概览。我们发现，与对照组相比，TB小鼠下丘脑中促食欲神经肽NPY和AgRP的表达较高，而厌食基因CCK和POMC的表达较低。此外，发现TB小鼠中血清素和多巴胺信号通路发生显著改变。

与对照组小鼠相比，结核病小鼠脑内5-羟色胺水平降低，而多巴胺水平未发生变化。此外，5-羟色胺水平与食物摄入量呈负相关。对食物摄入量增加的恶病质结核病小鼠下丘脑进行的转录组分析显示，NPY、AgRP和5-羟色胺信号通路发生改变。脑内5-羟色胺水平显示与食物摄入量变化相关。靶向这些系统似乎是避免癌症诱导的进食障碍发展的一种有前景的策略。总体设计：将C26结肠腺癌细胞皮下接种于CDF1小鼠。20天后，解剖下丘脑并进行基因表达谱分析。总数据集由2部分组成；数据集1为一项初步研究，其中小鼠被注射了递增

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别