RM1 股骨内接种小鼠背根神经节单细胞测序
该数据集为 NCBI BioProject 收录的小鼠背根神经节单细胞测序项目,围绕 RM1 细胞股骨内接种模型展开,主题标签为转录组或基因表达

基本信息
资源简介
RM1 股骨内接种小鼠背根神经节单细胞测序
该数据集为 NCBI BioProject 收录的小鼠背根神经节单细胞测序项目,英文名称为 PRJNA1463258: Murine Dorsal Root Ganglion Single Cell Sequencing of RM1 Intrafemoral Inoculation,源站标题为 Murine Dorsal Root Ganglion Single Cell Sequencing... (ID 1463258) - BioProject - NCBI。项目围绕 RM1 细胞股骨内接种模型展开,主题标签为转录组或基因表达,本站分类归入肿瘤 / 其他。该数据集的核心价值在于将单细胞测序技术应用于小鼠背根神经节,并结合 RM1 细胞股骨内接种这一实验模型,为研究肿瘤与神经系统的相互作用提供转录组层面的数据基础。背根神经节作为感觉神经传导的重要节点,其单细胞水平的基因表达信息有助于揭示不同细胞类型的组成与状态变化,而 RM1 细胞股骨内接种模型则提供了肿瘤骨内生长的实验背景,两者结合使该数据集在肿瘤神经生物学研究中具有潜在意义。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject,是一个围绕单一研究计划组织的生物数据集合。BioProject 记录的设计目标是为用户提供一个统一入口,以便查找同一项目所产生的多种数据类型。该项目聚焦于小鼠背根神经节的单细胞测序,并以 RM1 细胞股骨内接种为实验模型。RM1 是一种常用于小鼠肿瘤研究的细胞系,股骨内接种则模拟了肿瘤在骨内生长的情形。将背根神经节纳入研究,意味着项目关注肿瘤生长过程中感觉神经节可能发生的转录组变化。主题标签为转录组或基因表达,说明该项目的核心数据属于基因表达层面,而非基因组、蛋白组或其他类型。本站将其分类为肿瘤 / 其他,反映了该数据集在肿瘤研究领域中的归属,同时“其他”也提示其可能涉及肿瘤学与神经科学的交叉方向。
【数据内容】
该数据集的内容为小鼠背根神经节的单细胞测序数据,主题标签明确指向转录组或基因表达。单细胞测序能够在单个细胞水平上获取基因表达信息,从而区分背根神经节中不同细胞类型的表达特征。项目名称中的“Murine Dorsal Root Ganglion Single Cell Sequencing”表明测序对象为小鼠背根神经节,而“RM1 Intrafemoral Inoculation”则说明这些背根神经节样本与 RM1 细胞股骨内接种模型相关。源站描述仅对 BioProject 这一记录类型进行了一般性说明,未进一步列出该数据集的具体样本数量、测序平台、数据量或分析结果。因此,关于数据内容的具体细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录,项目编号为 1463258。源站标题显示其英文全称为 Murine Dorsal Root Ganglion Single Cell Sequencing... (ID 1463258) - BioProject - NCBI。BioProject 作为生物数据集合,通常由单一组织或联盟发起,用于汇集与某一研究计划相关的多种数据类型。该项目的具体提交机构、样本采集地点、动物饲养条件、接种操作细节以及测序服务提供方等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤与神经系统交互作用的研究场景,尤其是关注 RM1 细胞股骨内接种后小鼠背根神经节转录组变化的研究。单细胞测序数据可用于探索背根神经节内不同细胞亚群的基因表达模式,帮助研究者识别在肿瘤骨内生长条件下可能发生变化的感觉神经元、卫星细胞或其他细胞类型。此外,该数据集也可作为转录组或基因表达分析的方法学参考,用于单细胞数据分析流程的建立与验证。由于本站分类为肿瘤 / 其他,它还可能适用于肿瘤学与神经科学交叉领域的探索性研究。但具体适用场景需结合源站提供的原始数据与元数据加以判断,源站未提供更详细的适用建议。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库访问,项目编号为 1463258。用户可在 NCBI 网站上检索该编号或英文名称,获取与该项目相关的数据链接。BioProject 记录本身提供的是项目层面的入口,用户可据此进一步查找该项目产生的转录组或基因表达数据。具体的数据下载方式、文件格式、分析工具与处理流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject,属于公共数据库收录的项目记录。其质量与限制取决于原始研究的设计、样本处理与测序过程,但源站描述未提供相关质量控制信息、样本量、测序深度、覆盖度或数据完整性说明。此外,源站描述仅对 BioProject 的一般功能进行说明,未对该数据集的具体质量指标作出评价。因此,关于该数据集的质量与限制,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用方式与许可信息,源站未提供。用户在使用时应参考 NCBI BioProject 记录页面中可能附带的引用说明与使用条款,但具体内容需以源站实际提供的信息为准。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1463258
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们采用10x Genomics单细胞RNA测序技术,运用单细胞测序方法研究了小鼠背根神经节(DRG)感觉神经元在癌症诱导的骨痛中的作用。DRG是感觉神经元和疼痛信号传导的中枢。这些发现建立了一个肿瘤携带者的参考数据集。
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