PRJNA1456598：U2AF1突变挽救KRAS突变诱导的有害外显子跳跃 [RNA-Seq]
该数据集来自 NCBI BioProject（编号 PRJNA1456598），主题为 U2AF1 突变挽救 KRAS 突变诱导的有害外显子跳跃，采用 RNA-Seq 技术，属于转录组或基因表达范畴
![PRJNA1456598: U2AF1 mutations rescue deleterious exon skipping induced by KRAS mutations [RNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/84837_v20261104204334.jpg)
基本信息
资源简介
PRJNA1456598：U2AF1突变挽救KRAS突变诱导的有害外显子跳跃 [RNA-Seq]
该数据集为 NCBI BioProject 收录的 RNA-Seq 项目，编号 PRJNA1456598，英文标题为“U2AF1 mutations rescue deleterious exon skipping induced by KRAS mutations [RNA-Seq]”。从标题可以看出，该项目围绕 U2AF1 突变与 KRAS 突变之间的相互作用展开，重点关注 U2AF1 突变对 KRAS 突变所诱导的有害外显子跳跃的挽救效应。项目采用 RNA-Seq 技术，属于转录组或基因表达研究范畴，本站将其归类于肿瘤 / 其他方向。整体而言，该数据集提供了一个以基因表达和转录本层面变化为核心的生物学项目记录，便于研究者定位与可变剪接、突变互作相关的转录组数据。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，编号为 PRJNA1456598。BioProject 是围绕某一项研究计划或项目而组织的生物数据集合，通常来自单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，用以查找该项目所产生的多种类型数据。该项目的标题明确指向 U2AF1 突变与 KRAS 突变之间的关系，尤其是 U2AF1 突变对 KRAS 突变所诱导的有害外显子跳跃的挽救作用。主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明项目聚焦于转录组或基因表达层面。本站分类为肿瘤 / 其他，提示该项目可能与肿瘤相关研究背景有关。
【数据内容】
该数据集的核心内容为 RNA-Seq 数据，属于转录组或基因表达范畴。项目标题涉及 U2AF1 突变、KRAS 突变以及外显子跳跃，表明数据可能用于分析基因表达变化和可变剪接事件。源站描述仅对 BioProject 的性质作出通用说明，未提供该项目的样本数量、测序平台、读长、数据量、分析流程或具体结果等细节。除标题、主题标签和分类信息外，源站未提供更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来自 NCBI BioProject，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 PRJNA1456598。源站描述指出，BioProject 记录汇集与单一研究计划相关的生物数据，并来自单一组织或联合体，为用户提供查找多种数据类型的统一入口。关于样本采集方式、实验设计、测序机构、地理来源或时间信息，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签和标题，该数据集适用于转录组或基因表达相关研究场景，尤其是涉及 U2AF1 突变、KRAS 突变以及外显子跳跃的分析。研究人员可将其用于探索突变背景下可变剪接变化、基因表达调控或突变间相互作用等方向。由于本站分类为肿瘤 / 其他，也可能适用于肿瘤相关的基础研究。具体适用场景需结合源站提供的原始记录进一步确认，源站未提供更详细的适用说明。
【使用方法】
该数据集为 NCBI BioProject 记录，用户可通过 BioProject 编号 PRJNA1456598 在 NCBI 平台查找与该计划相关的多种数据类型。源站描述强调，BioProject 记录提供统一入口以链接项目产生的不同数据。关于数据下载方式、文件格式、分析工具或处理步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共数据库记录。源站描述仅说明 BioProject 的组织方式与用途，未提供该项目的质量控制指标、数据完整性、覆盖度或验证信息。由于缺乏样本数量、测序深度、平台信息及分析细节，无法对数据质量作出具体判断。源站未提供相关质量与限制说明。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI BioProject，编号为 PRJNA1456598。关于该项目的引用方式、许可条款或使用限制，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1456598
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
剪接因子基因U2AF1的突变如何促进肺腺癌发病机制的机制尚不清楚。在此，我们使用先导编辑技术修改肺腺癌细胞中的内源性U2AF1基因，并评估了其对可变剪接的影响。一种特定的KRAS突变，G12S，导致KRAS外显子2跳跃并生成无功能的KRAS转录本。然而，U2AF1 S34F突变体的表达可逆转这种外显子跳跃并恢复KRAS功能，从而导致U2AF1 S34F突变在KRAS G12S突变型肺腺癌中富集。对癌症基因组中剪接因子/癌基因突变共发生的全面分析还揭示了KRAS Q61R和U2AF1 I24T突变的显著共富集。在实验上，KRAS Q61R突变导致KRAS外显子3跳跃，而这又可以通过U2AF1 I24T的表达得以挽救。我们的发现提供了证据，表明剪接因子突变可以在级联选择的动态过程中挽救由致癌突变引起的剪接缺陷。
总体设计：为了确定U2AF1突变对KRAS及其他靶点剪接的影响，我们对携带U2AF1和KRAS突变的工程化肺腺癌细胞系进行了短读长RNA测序。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
