PRJNA1429389:尤文肉瘤遗传易感性

BioProject 是汇集与单一研究计划相关的生物数据的集合,该计划源自单一组织或联盟。BioProject 记录为用户提供一个统一的位置,以查找为该计划生成的各种数据类型的链接

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表格肿瘤尤文肉瘤遗传易感性BioProjectNCBI
PRJNA1429389: Genetic Susceptibility to Ewing Sarcoma

基本信息

模态
表格
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1429389:尤文肉瘤遗传易感性

PRJNA1429389: Genetic Susceptibility to Ewing Sarcoma 是来源于 NCBI BioProject 数据库的一项生物研究计划记录,其源站标题为 Genetic Susceptibility to Ewing Sarcoma (ID 1429389) - BioProject - NCBI。该记录归属于肿瘤 / 其他这一分类,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 是汇集与单一研究计划相关的生物数据的集合,该计划源自单一组织或联盟。BioProject 记录为用户提供一个统一的位置,以查找为该计划生成的各种数据类型的链接。因此,该数据集可被理解为围绕尤文肉瘤遗传易感性这一研究方向所组织的生物数据入口,便于研究者从统一位置获取与该计划相关的多种数据类型链接。

【数据集背景】

该数据集对应的是一项名为 Genetic Susceptibility to Ewing Sarcoma 的研究计划,登记于 NCBI BioProject,编号为 1429389。从名称来看,该计划关注尤文肉瘤的遗传易感性,属于肿瘤研究领域中的遗传与易感机制方向。BioProject 的定位是汇集与单一研究计划相关的生物数据,这些计划可以源自单一组织,也可以源自联盟。该记录作为 BioProject 中的一条条目,为用户提供查找该计划所生成各类数据的统一入口。关于该计划的具体发起组织、联盟成员、资助来源、研究周期等背景信息,源站未提供。

【数据内容】

该数据集所涵盖的具体数据内容,源站未提供。BioProject 记录本身并不一定直接包含所有原始数据文件,而是提供指向该计划所生成的各种数据类型的链接。因此,该记录可能关联多种生物数据类型,但具体包含哪些样本、测序数据、变异信息、临床信息或其他数据,源站未提供。该数据集在分类上属于肿瘤 / 其他,说明其与肿瘤研究相关,但具体数据构成需以源站记录中的链接和说明为准。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 的 BioProject 数据库。BioProject 是汇集与单一研究计划相关的生物数据的集合,该计划源自单一组织或联盟。该记录提供了一个统一的位置,以查找为该计划生成的各种数据类型的链接。关于该计划的具体样本采集方式、采集地点、采集时间、纳入排除标准、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于需要查找与尤文肉瘤遗传易感性相关生物数据链接的研究人员。由于 BioProject 记录提供统一入口,用户可以通过该记录定位到该计划生成的各种数据类型,进而用于遗传易感性分析、肿瘤相关研究、数据整合或二次分析等场景。具体适用场景取决于该计划实际生成的数据类型,而源站未提供这些具体信息。因此,该数据集更适合作为数据发现与导航的起点,而非直接等同于某一特定分析数据集。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问编号为 1429389 的记录,即 PRJNA1429389。该记录提供指向该计划所生成各种数据类型的链接,用户可根据自身研究需要,从统一位置跳转至相应的数据资源。关于具体下载方式、数据格式、访问权限、是否需要申请、是否提供 API 或批量下载工具等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的质量控制信息、数据完整性、准确性、覆盖度、更新频率等,源站未提供。由于 BioProject 记录主要作为研究计划的汇总入口,其本身并不必然包含对所有关联数据的质量评价。用户在使用时应注意,具体数据质量需依据各关联数据资源自身的说明进行判断。此外,该记录的具体限制条件、使用约束、隐私或伦理限制等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、是否允许再分发或商业使用等信息,源站未提供。用户在引用或使用该数据集时,应参考 NCBI BioProject 源站记录及其关联数据资源所附带的引用与许可说明。由于源站未提供具体许可信息,无法在本描述中给出明确的许可结论。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1429389

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自儿童肿瘤学组(COG)和居里研究所的487例尤文肉瘤(EWS)病例的血液来源DNA样本,由美国国家癌症研究所(NCI)使用Illumina全球筛查阵列(GSA)进行了基因分型。这些样本与前列腺、肺、结直肠和卵巢筛查试验(PLCO)的对照样本进行了匹配,并使用TOPMed插补服务器将数据插补至Trans-Omics for Precision Medicine(TOPMed)版本r3参考面板。这项病例对照研究是作为尤文肉瘤更大规模荟萃分析的一部分进行的。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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