胰腺导管腺癌微环境重编程：新型整合素靶向细胞毒素ProAgio增强化疗效果[RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1372230

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

胰腺导管腺癌（PDAC）的生长和转移受肿瘤微环境（TME）的影响，TME包括免疫细胞、内皮细胞、巨噬细胞和癌相关成纤维细胞（CAFs）。由于新型整合素靶向细胞毒素ProAgio能够调节TME，我们在基因工程（GEM）小鼠模型和PDAC小鼠模型中研究了其与多种传统化疗药物的联合应用。ProAgio联合化疗显著调节了TME，改善了缺氧状态，降低了肿瘤重量，并消除了向肺和肝的转移。值得注意的是，与单独使用任一治疗相比，ProAgio联合吉西他滨治疗还提高了GEM模型动物的总生存期。单细胞RNA测序（scRNA seq；获取自GEM模型动物）、流式细胞术、免疫荧光和免疫组织化学分析表明，ProAgio联合化疗通过将活化的CAFs转变为静息态CAFs（qCAFs）、将巨噬细胞从促肿瘤极化转变为促炎极化，以及激活自然杀伤（NK）细胞、CD4⁺和CD8⁺ T细胞，重编程了PDAC的TME。联合治疗抑制了PDAC的干性。

体外经ProAgio处理的CAFs表现出甘氨酸和半胱氨酸分泌减少，而这两种重要代谢物支持干性和肿瘤进展。这些结果突显了ProAgio通过调节PDAC-ME和改善缺氧来增强化疗疗效的潜力。总体设计：GEM-KPC小鼠（LSL-KrasG12D/+；LSL-Trp53 R172H/+；Pdx-1-Cre）购自Jackson Laboratory（缅因州巴港）。这些小鼠通过将LSL-KrasG12D/+与LSL-Trp53R172H/+交配，然后将所得杂合子与Pdx-1-Cre繁育而创建。GEM-KPC小鼠的治疗在14周龄时开始。实验细节在表1和图4A中描述和描绘。最初，它们接受ProAgio（10mg/Kg；腹腔注射）连续10次剂量治疗，随后每隔一天给予10次剂量。吉西他滨（50m

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。