PRJNA1368855：ADAM10抑制在DLD-1和SW620结直肠癌细胞系中的RNA-seq分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1368855

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨了ADAM10抑制在两种人结直肠癌细胞系DLD-1和SW620中的转录组效应。细胞经载体对照或构象特异性ADAM10单克隆抗体1H5处理48小时后，提取总RNA并进行配对末端RNA测序。该数据集可用于比较分析不同结直肠癌遗传背景中ADAM10调控的通路，包括Notch和EGFR信号传导的改变、代谢基因程序以及与肿瘤进展相关的其他通路。总体设计：人结直肠癌细胞系DLD-1和SW620经载体对照或靶向ADAM10的单克隆抗体1H5（40 μg/mL）处理48小时后提取总RNA。细胞在标准条件下培养，使用基于柱的提取方法进行RNA分离。进行RNA-seq以表征ADAM10抑制在两种结直肠癌遗传背景中诱导的全局转录变化，并鉴定与Notch信号传导、EGFR信号传导和癌症代谢相关的调控通路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。