PRJNA133365：卵巢癌数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA133365

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景。全基因组表达变化与卵巢癌（OVCA）患者化疗耐药的发生相关；细胞死亡Bcl2拮抗因子（BAD）凋亡通路可能在临床结局中发挥作用。方法。我们分析了来自1，406例患者和116个癌细胞系的标本和/或基因组数据。在经历总共144个（顺铂）治疗/恢复周期的OVCA细胞系中，评估了全基因组表达变化和顺铂耐药性。对与顺铂耐药性增加相关的基因进行了通路分析。在患者样本和细胞系中研究了BAD蛋白磷酸化，并使用小干扰RNA（siRNA）探索该通路作为治疗靶点。我们利用来自60个人类癌细胞系以及来自1，258例患者的卵巢癌、乳腺癌、结肠癌和脑癌的基因组数据，评估了BAD通路表达对化疗敏感性和/或临床结局的影响。结果。BAD通路与OVCA细胞系顺铂耐药性的演变相关（P<0.001），并且与7种人类癌细胞类型对8种细胞毒性药物的耐药性相关（P<0.05）。

卵巢癌化疗耐药与BAD蛋白磷酸化相关，靶向siRNA调控可产生相应的化疗敏感性变化。一个包含47个基因的BAD通路特征与1，258例卵巢癌、乳腺癌、结肠癌和脑癌患者的生存相关。卵巢癌BAD通路特征的生存优势独立于手术减瘤状态。结论：BAD凋亡通路影响人类癌症对多种化疗药物的敏感性，可能通过调节BAD磷酸化实现。该通路具有临床意义，可作为治疗反应和患者生存的潜在生物标志物，并是一个有前景的治疗靶点。总体设计：28例晚期浆液性上皮性卵巢癌在初次手术时切除，这些患者将接受以铂类为基础的

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。