phs000824:全基因组发现新型结肠癌易感突变
源站描述为 dbGaP study (Case Set),即该研究以病例集合形式提供数据,聚焦于全基因组层面发现新型结肠癌易感突变

基本信息
资源简介
phs000824:全基因组发现新型结肠癌易感突变
phs000824: Genome-Wide Discovery of Novel Colon Cancer Predisposing Mutations 是一个以病例集合形式组织并提供的肿瘤相关数据集,其核心目标是在全基因组层面发现新型结肠癌易感突变。该数据集来源于 NCBI 的 dbGaP 研究资源,属于病例集合类型的数据,主题标签为 Case Set。从整体定位来看,该数据集面向结肠癌遗传易感性的探索性研究,适合关注结肠癌 predisposing mutations 的研究者使用。由于数据以病例集合形式提供,其设计重点在于围绕病例样本开展全基因组范围的突变发现工作,而非一般性的健康人群对照或流行病学调查。该数据集在分类上归入肿瘤 / 其他,说明其主题与肿瘤相关,但在具体细分方向上可能不局限于某一类常见肿瘤子类。整体而言,该数据集为结肠癌易感突变的发现研究提供了一个可获取的数据资源入口。
【数据集背景】
该数据集英文名称为 phs000824: Genome-Wide Discovery of Novel Colon Cancer Predisposing Mutations,其研究背景聚焦于结肠癌的遗传易感性。结肠癌作为一种肿瘤类型,其发生发展可能涉及多种遗传因素,而该数据集所对应的研究旨在从全基因组层面发现新的、此前未被识别的易感突变。数据集来源于 NCBI 的 dbGaP 研究资源,属于 dbGaP study 的一种,并以 Case Set 的形式提供。主题标签为 Case Set,进一步表明该数据集的组织方式以病例集合为核心。该数据集在分类上属于肿瘤 / 其他,说明其与肿瘤领域相关,但在分类体系中可能未被归入更细的特定子类。源站描述仅指出其为 dbGaP study (Case Set),未提供更多关于研究设计、样本规模、随访信息或具体突变位点的细节。
【数据内容】
该数据集以病例集合形式提供数据,主题标签为 Case Set。其研究目标为全基因组层面发现新型结肠癌易感突变。源站描述仅说明其为 dbGaP study (Case Set),未提供关于数据具体内容、变量字段、基因组数据格式、突变列表、样本数量或临床注释的进一步信息。因此,关于数据内容的具体构成,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP study,并以 Case Set 形式提供。源站描述仅指出其为 dbGaP study (Case Set),未提供样本采集方式、采集地点、采集时间、纳入排除标准、伦理审批或知情同意等具体信息。因此,关于采集与来源的详细过程,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于在肿瘤 / 其他分类下,围绕结肠癌易感突变发现开展的研究场景。由于其以病例集合形式提供,并聚焦于全基因组层面发现新型结肠癌易感突变,潜在适用方向包括结肠癌遗传易感性的探索、候选易感突变的发现以及相关病例集合的遗传分析。源站描述未提供关于具体分析场景、对照设置、验证方法或临床应用方向的更多信息。因此,关于适用场景的进一步细节,源站未提供。
【使用方法】
该数据集来源于 dbGaP,属于 dbGaP study (Case Set)。通常 dbGaP 数据的使用需要遵循源站的数据访问流程与授权要求,但源站描述未提供该数据集的具体使用方法、访问级别、下载方式、分析工具或操作步骤。因此,关于使用方法的详细说明,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集以病例集合形式提供,主题标签为 Case Set,研究目标为全基因组层面发现新型结肠癌易感突变。源站描述仅说明其为 dbGaP study (Case Set),未提供关于数据质量、完整性、准确性、批次效应、样本量、统计效力或研究局限性的具体信息。因此,关于质量与限制的详细评估,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP study (Case Set)。源站描述未提供具体的引用格式、许可条款、数据使用协议或授权要求。因此,关于引用与许可的具体内容,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000824
标准获取流程:
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- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
dbGaP study (Case Set).
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




