p97/VCP 抑制通过过度 MRE11 依赖性 DNA 末端切除使癌细胞对放疗敏感

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD016279

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

癌细胞持续处于蛋白质毒性应激之下，并伴有基因组不稳定性的增加。因此，它们依赖蛋白质稳态和DNA损伤反应（DDR）的上调来维持生存。泛素依赖性ATP酶p97是泛素-蛋白酶体降解系统（UPS）的核心组分，参与蛋白质稳态和DDR。p97在许多肿瘤中过表达，其过表达与患者预后不良相关。为了探索通过联合靶向DDR和蛋白质稳态来杀伤癌细胞的概念，我们在膀胱癌细胞系和小鼠异种移植模型中，通过电离辐射（IR）诱导DNA损伤，并用CB-5083（一种特异性p97小分子抑制剂）抑制蛋白质稳态。联合治疗诱导了放射敏感性并抑制了异种移植肿瘤生长。机制上，p97 ATP酶活性的失活导致核酸酶MRE11在IR诱导的DNA损伤位点发生蛋白质毒性积累。

这导致单链DNA（ssDNA）过度形成，抑制同源重组（HR），依赖单链退火（SSA）进行双链断裂（DSB）修复，并在非同源末端连接缺陷的肿瘤细胞（如肌层浸润性膀胱癌患者的肿瘤细胞）中，经电离辐射（IR）暴露后产生合成致死效应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。