下一代个性化神经母细胞瘤治疗

该数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦神经母细胞瘤及其他癌症。研究在肿瘤复发时对肿瘤细胞进行活检与深度测序,识别方案指定的生物标志物,并将可操作的基因组异常与合理设计的分子靶向药物组合进行匹配,从而为参与者分配相应治疗

Yael P MosseYael P Mosse
clinicaltrials
浏览 2
基因组分类NeuroblastomaCancer
Next Generation Personalized Neuroblastoma Therapy

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-31

资源简介

下一代个性化神经母细胞瘤治疗

Next Generation Personalized Neuroblastoma Therapy 是一个聚焦神经母细胞瘤及其他癌症的研究数据集,来源为 clinicaltrials.gov。该研究旨在将肿瘤复发时肿瘤细胞中的基因组异常与合理设计的分子靶向药物组合进行匹配。研究分为两部分:第一部分在入组时通过活检获取肿瘤组织并进行深度测序,以识别方案指定的生物标志物用于治疗分配;第二部分在肿瘤含有研究定义为可操作的遗传改变且满足其他条件时,依据肿瘤活检中识别的遗传改变为参与者分配治疗。数据集以神经母细胞瘤和癌症为主题标签,整体围绕复发肿瘤的分子特征识别与靶向治疗匹配展开。

【数据集背景】

该数据集对应的研究关注神经母细胞瘤及其他癌症在复发阶段的治疗决策问题。源站描述指出,研究的目的是将肿瘤细胞在复发时的基因组异常与合理设计的分子靶向药物组合进行匹配。这一背景决定了数据集的核心主题是肿瘤基因组信息与治疗分配之间的关联,而非单纯的疾病登记或一般性临床观察。研究设计明确分为两部分,第一部分聚焦于通过活检和深度测序识别方案指定的生物标志物,第二部分则聚焦于在识别出可操作遗传改变后进行治疗分配。

【数据内容】

数据集的主题标签为神经母细胞瘤和癌症。根据源站描述,研究涉及的条件包括神经母细胞瘤与癌症。数据内容围绕肿瘤活检与深度测序所识别的方案指定生物标志物展开,并涉及研究定义为可操作的遗传改变。研究第二部分的条件包括肿瘤含有研究定义的 actionable 遗传改变以及其他标准得到满足。数据内容的核心要素包括肿瘤细胞在复发时的基因组异常信息、方案指定的生物标志物,以及基于这些遗传改变所分配的治疗方案。源站未提供具体的字段结构、变量列表或数据记录格式。

【采集与来源】

数据来源站为 clinicaltrials.gov。采集方式与研究设计相关:研究入组时通过活检获取肿瘤组织,并对其进行深度测序,以识别方案指定的生物标志物用于治疗分配。研究第二部分依据肿瘤活检中识别的遗传改变进行 therapy assignment。源站未提供样本量、采集时间跨度、随访频率或数据更新机制等具体信息。

【适用场景】

该数据集适用于与神经母细胞瘤及其他癌症相关的转化研究和临床研究场景,尤其是关注复发肿瘤基因组异常与分子靶向药物组合匹配的研究。其内容可用于理解如何通过活检与深度测序识别方案指定的生物标志物,以及如何在满足可操作遗传改变等条件时进行治疗分配。适用场景还包括对肿瘤分子特征与治疗选择之间关联的方法学研究。源站未提供具体的分析用途、建模场景或验证任务说明。

【使用方法】

源站描述表明,研究分为两部分:第一部分在 study entry 时通过活检获取肿瘤并开展深度测序,识别 protocol-specified biomarkers 用于 therapy assignment;第二部分在肿瘤含有研究定义为 actionable 的 genetic change 且其他 criteria 满足时,依据肿瘤活检中识别的 genetic changes 为参与者分配 therapy。使用方法应围绕这一两阶段设计理解数据:先获取肿瘤组织并进行深度测序,再依据识别的生物标志物和可操作遗传改变进行治疗匹配。源站未提供数据访问方式、文件格式、字段说明或分析工具等操作细节。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、完整性、准确性或验证方式的具体信息。已知限制包括:研究设计依赖活检与深度测序,且治疗分配需满足研究定义的可操作遗传改变及其他标准;源站描述未提供样本规模、中心数量、数据更新频率或缺失数据处理方式。该数据集聚焦神经母细胞瘤及其他癌症,其内容范围以源站描述为限,源站未提供更广泛疾病领域或非肿瘤应用的说明。

【引用与许可】

源站未提供引用格式、许可条款或使用限制信息。数据集来源站为 clinicaltrials.gov,英文名称为 Next Generation Personalized Neuroblastoma Therapy。引用与许可相关细节需以源站发布信息为准,当前描述不包含具体授权方式或使用条件。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT02780128

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病:神经母细胞瘤、癌症。本研究的目的是将复发时肿瘤细胞中的基因组异常与合理设计的分子靶向药物组合进行匹配。本研究将分为两部分:第一部分:在研究入组时通过活检获取肿瘤组织,并进行深度测序,以识别方案规定的用于治疗分配的生物标志物。第二部分:如果肿瘤含有本研究定义为可靶向的遗传改变,且符合其他标准,参与者将根据肿瘤活检中识别出的遗传改变被分配至相应治疗。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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