分子数据集:结直肠癌患者日常临床实践中突变定制抗EGFR治疗选择的全国性评估
该数据集来自荷兰全国性病理登记系统PALGA,收集了2017年10月1日至2019年6月30日共21个月期间结直肠癌患者的分子病理报告

基本信息
资源简介
分子数据集:结直肠癌患者日常临床实践中突变定制抗EGFR治疗选择的全国性评估
Molecular dataset: Nationwide evaluation of mutation-tailored anti-EGFR therapy selection in patients with colorectal cancer in daily clinical practice
该数据集来自荷兰全国性病理登记系统PALGA,收集了2017年10月1日至2019年6月30日共21个月期间结直肠癌患者的分子病理报告。经人工整理,共纳入4060例接受预测性突变分析的患者,并提取了突变分析的技术、基因panel及诊断产出等详细信息。数据可用于评估日常临床实践中基于突变状态选择抗EGFR治疗的实际情况,支持结直肠癌分子诊断与精准治疗的相关研究(来源 DOI 解析)。
【数据集背景】
源站首次发布:2021。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):使用特定查询从PALGA收集了2017年10月1日至2019年6月30日期间结直肠癌患者的分子病理报告(详情见:图1A PMID: 34675090 / DOI: 10.1136/jclinpath-2021-207865)。对这些报告的人工整理显示,在这21个月的研究期间,有4060例结直肠癌患者接受了预测性突变分析。突变分析的详细信息(即技术、基因panel、诊断产出)已从这些报告中人工提取,并展示在当前数据集中。
【主题与分类】
主题标签:Medicine, Health and Life Sciences、colorectal neoplasms、diagnostic techniques and procedures、molecular、pathology。本站分类:肿瘤/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://lifesciences.datastations.nl/citation?persistentId=doi:10.17026/dans-xuz-b464
下载信息
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源站:https://doi.org/10.17026/DANS-XUZ-B464
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
从PALGA收集了2017年10月1日至2019年6月30日期间结直肠癌患者的分子病理学报告,使用特定查询(详情参见:图1A PMID: 34675090 / DOI: 10.1136/jclinpath-2021-207865)。对这些报告的手工整理显示,在这21个月的研究期间,有4060名接受预测性突变分析的结直肠癌患者。突变分析的详细信息(即技术、基因面板、诊断产出)已从这些报告中手工提取,并展示在当前数据集中。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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