大型未选择转移性结直肠癌队列的分子特征与原发性肿瘤位置、罕见转移部位及预后的关系
该数据集来自一项基于人群的转移性结直肠癌(mCRC)研究,覆盖斯堪的纳维亚三个地区798例患者,使用定制Ampliseq热点面板检测44个癌症相关基因,并结合错配修复状态、原发肿瘤位置及骨/脑转移情况分析突变分布与生存差异

基本信息
资源简介
大型未选择转移性结直肠癌队列的分子特征与原发性肿瘤位置、罕见转移部位及预后的关系
Molecular characterization of a large unselected cohort of metastatic colorectal cancers in relation to primary tumor location, rare metastatic sites and prognosis
该数据集来自一项基于人群的转移性结直肠癌(mCRC)研究,覆盖斯堪的纳维亚三个地区798例患者,使用定制Ampliseq热点面板检测44个癌症相关基因,并结合错配修复状态、原发肿瘤位置及骨/脑转移情况分析突变分布与生存差异。数据包含补充方法与补充图表文件,可用于探索mCRC分子特征、罕见转移部位相关突变及预后关联(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
配套论文《Molecular characterization of a large unselected cohort of metastatic colorectal cancers in relation to primary tumor location, rare metastatic sites and prognosis》发表于 Acta Oncologica(2020),DOI:10.1080/0284186X.2019.1711169。项目资助方:This work was supported by the Swedish Cancer Society under Grant CAN 2016/447 and CAN 2018/1165.。源站首次发布:2020-01-16。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:我们曾报道,在基于人群的转移性结直肠癌(mCRC)患者队列中,BRAF V600E突变和微卫星高度不稳定(MSI-H)的患病率高于临床试验或医院患者组的报道。本研究旨在探讨mCRC中其他突变在这些队列间的患病率差异,及其与错配修复状态和原发肿瘤位置的关系,并分析骨或脑转移的存在是否与任何突变相关。材料与方法:使用来自斯堪的纳维亚三个地区的798例mCRC患者的基于人群队列。在定制设计的Ampliseq热点面板中检测了44个癌症相关基因。使用Kaplan–Meier估计器和Cox回归分析分析生存差异。结果:在449/501例患者中,可对40/44个基因进行突变测定。
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个,合计 1.02 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.11574726.v2。
【主题与分类】
源站学科分类:Medicine、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer。主题标签:RAS、metastatic colorectal cancer、brain metastases、BRAF V 600E mutations、798 mCRC patients、mismatch repair status、tumor location、population-based cohort、ERBB 2 alterations、Ampliseq hotspot panel。本站分类:肿瘤/其他。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology、Biological Sciences not elsewhere classified、Cancer。
【获取与许可】
源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Molecular_characterization_of_a_large_unselected_cohort_of_metastatic_colorectal_cancers_in_relation_to_primary_tumor_location_rare_metastatic_sites_and_prognosis/11574726
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Molecular characterization of a large unselected cohort of metastatic colorectal cancers in relation to primary tumor location, rare metastatic sites and prognosis. Taylor & Francis. Nunes, Luís; Aasebø, Kristine; Mathot, Lucy; Ljungström, Viktor; Edqvist, Per-Henrik; Sundström, Magnus; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-05,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.11574726
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 1.0 MB。
数据说明
背景:我们曾报道,在基于人群的转移性结直肠癌(mCRC)患者队列中,BRAF V600E突变和微卫星高度不稳定(MSI-H)的发生率高于临床试验或医院来源患者群体的报道。本研究旨在探讨mCRC中其他突变的发生率在这些队列间是否存在差异,并分析其与错配修复状态及原发肿瘤部位的关系,以及骨或脑转移的存在是否与任何突变相关。材料与方法:研究采用来自斯堪的纳维亚三个地区的798例mCRC患者的基于人群队列。使用定制设计的Ampliseq热点面板检测了44个癌症相关基因。采用Kaplan–Meier估计法和Cox回归分析生存差异。结果:在449/501例患者中,可对40/44个基因进行突变检测。除BRAF V600E在19%的肿瘤中可见外,其他突变的发生率均未高于试验队列。
BRAF V600E和MSI-H见于8%的病例,与不良预后相关;与左侧和直肠肿瘤合并相比,右侧原发肿瘤位置(39%)也与不良预后相关;然而,在多变量回归分析中,只有BRAF突变保留了统计学显著性。未发现其他突变与不良预后相关。若诊断时存在骨转移,ERBB2改变更为常见(17% vs. 4%,p = .011)。未发现与脑转移的关联。52%的患者存在可用FDA批准的靶向治疗进行治疗的改变,主要是针对RAS野生型的EGFR抑制剂和针对MSI-H肿瘤的检查点抑制剂。结论:右侧肿瘤位置、BRAF V600E突变(但未发现其他所研究的突变)以及MSI-H在未经选择的队列中比临床患者队列报告更为常见,很可能是因为它们提示不良预后。半数患者的肿瘤可用已
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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