Lynch综合征内镜监测的液体活检生物标志物

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07838246

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：Lynch综合征、遗传性非息肉病性结直肠癌、HNPCC、结直肠癌（CRC）、结直肠肿瘤。依据：Lynch综合征由DNA错配修复基因（MLH1、MSH2、MSH6、PMS2，或通过MSH2失活影响的EPCAM）之一的胚系致病性变异引起。LS携带者所发生的肿瘤特征性地表现为微卫星不稳定性，其在结直肠癌变过程中早期出现，同时免疫组化显示一种或多种MMR蛋白表达缺失。MMR缺陷易导致编码单核苷酸重复序列发生移码突变，这些突变近期已在MSI高/MMR缺陷肿瘤患者的外周血中被检测到。在意大利，每年新诊断结直肠癌病例超过50,000例，其中约3-5%与LS相关。尽管LS相对不常见，但其与结直肠癌终生风险显著增加相关，包括与一般人群相比，50岁前发生结直肠癌的风险约高14倍，以及异时性肿瘤风险增加。

从20-25岁开始进行结肠镜监测并每1-2年重复一次，是目前唯一确立的降低结直肠癌发病率和死亡率的策略。然而，结肠镜检查具有侵入性、费用高昂，且在多年终身监测后可能成为负担，可能影响依从性。此外，间期癌可能在预定检查之间发生。能够检测早期肿瘤性变化的微创生物标志物可改善风险分层、个性化监测间隔并提高患者依从性。循环肿瘤来源核酸，包括循环肿瘤DNA和microRNA，是结直肠癌检测和监测的有前景的生物标志物。MSI和MMR相关移码突变在肿瘤发生早期出现，可通过液体活检检测，而循环miRNA高度稳定并在结直肠癌早期发展中发生失调。粪便代表肿瘤来源DNA、miRNA和m的非侵入性来源

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。