基因组信息
包含76名肿瘤患者的临床和基因组信息(全外显子测序数据)。

基本信息
资源简介
基因组信息
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genomic information》。项目资助方:the National Key Research and Development Program of China (2018YFC1313302 and 2017YFC1308900), the Beijing Municipal Science and Technology Commission Program (Z141107002514013) the National Key Sci-Tech Special Project of China (2018ZX10302207), and the Digestive Medical Coordinated Development Center of Beijing Hospitals Authority (No.XXT19).。源站首次发布:2021-09-11。
【数据内容】
源站原始描述:This file contains clinical and genomic information of 76 patients whose tumor tissues were subjected to WES from PUCH cohort
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 16.43 KB。2. 76_patients(FFPE).xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,16.43 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.16607894.v1。
【主题与分类】
源站学科分类:Medical biochemistry and metabolomics not elsewhere classified。主题标签:Genomic Analysis、Biomarkers。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Genomic_information/16607894
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Jiao, Xi (2021). Genomic information. figshare. Dataset
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使用方式
数据集获取(Figshare)
- 源站标题:Genomic information
- DOI:10.6084/m9.figshare.16607894.v1
- 发布日期:2021-09-11
- 文件数:1 个
- 文件总体积:16.43 KB
- 源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Genomic_information/16607894
命令行下载
curl -L -o "2. 76_patients(FFPE).xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/30738203"
文件清单
2. 76_patients(FFPE).xlsx(16.43 KB)
文件总体积 16.43 KB(源站 API 实测)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
This file contains clinical and genomic information of 76 patients whose tumor tissues were subjected to WES from PUCH cohort.
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.16607894.v1(source: https://figshare.com/articles/dataset/Genomic_information/16607894)。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




