基因组信息

包含76名肿瘤患者的临床和基因组信息(全外显子测序数据)。

Jiao, XiJiao, Xi
Figshare
2021-09-11 更新
浏览 19
基因组Genomic AnalysisBiomarkers
Genomic information

基本信息

模态
基因组
大小
0.000016435 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2021-09-11
版本
v1

资源简介

基因组信息

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Genomic information》。项目资助方:the National Key Research and Development Program of China (2018YFC1313302 and 2017YFC1308900), the Beijing Municipal Science and Technology Commission Program (Z141107002514013) the National Key Sci-Tech Special Project of China (2018ZX10302207), and the Digestive Medical Coordinated Development Center of Beijing Hospitals Authority (No.XXT19).。源站首次发布:2021-09-11。

【数据内容】

源站原始描述:This file contains clinical and genomic information of 76 patients whose tumor tissues were subjected to WES from PUCH cohort

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 16.43 KB。2. 76_patients(FFPE).xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,16.43 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.16607894.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Medical biochemistry and metabolomics not elsewhere classified。主题标签:Genomic Analysis、Biomarkers。

【适用方向】

组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Genomic_information/16607894

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Jiao, Xi (2021). Genomic information. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "2. 76_patients(FFPE).xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/30738203"

文件清单

  • 2. 76_patients(FFPE).xlsx(16.43 KB)

文件总体积 16.43 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

This file contains clinical and genomic information of 76 patients whose tumor tissues were subjected to WES from PUCH cohort.

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.16607894.v1(source: https://figshare.com/articles/dataset/Genomic_information/16607894)。

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