滑膜肉瘤患者的基因组与转录组测序数据
数据覆盖该患者的基因组和转录组序列信息,可用于滑膜肉瘤的分子特征分析、个性化肿瘤基因组研究及相关变异探索(来源 EGA)

基本信息
资源简介
滑膜肉瘤患者的基因组与转录组测序数据
该数据集为来源于滑膜肉瘤患者的基因组与转录组序列数据,英文名称为 Genome and transcriptome sequence data from a synovial sarcoma patient,来源于 ega-archive.org,在分类上归属于肿瘤 / 其他类别。根据源站描述,这批数据是作为 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究的一部分而产生。数据覆盖该患者的基因组和转录组序列信息,可用于滑膜肉瘤的分子特征分析、个性化肿瘤基因组研究及相关变异探索。整体而言,该数据集面向肿瘤基因组学与个性化医疗研究方向,为滑膜肉瘤这一特定肿瘤类型的序列层面研究提供了来自真实患者的数据基础,适合需要围绕该病例开展基因组与转录组联合分析的研究者参考使用。
【数据集背景】
该数据集产生于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究框架之下。POG 研究以个性化肿瘤基因组学为导向,通过对患者肿瘤样本进行基因组与转录组层面的测序,探索个体化肿瘤分子特征。本数据集即为该研究产出的滑膜肉瘤患者序列数据,属于肿瘤 / 其他分类下的基因组学资源,来源站为 ega-archive.org。滑膜肉瘤作为一种较为特殊的软组织肿瘤,其分子层面的系统刻画对理解疾病机制和推动个体化诊疗具有研究价值,该数据集正是在这一背景下形成。
【数据内容】
数据内容覆盖该滑膜肉瘤患者的基因组和转录组序列信息。基因组序列数据对应患者肿瘤的 DNA 层面信息,转录组序列数据对应 RNA 层面信息,两者共同构成对该病例分子特征的序列层面记录。依据源站描述,这些数据可用于滑膜肉瘤的分子特征分析、个性化肿瘤基因组研究及相关变异探索。数据集英文名称明确指向“来自滑膜肉瘤患者的基因组与转录组序列数据”,表明其内容范围聚焦于单一患者的基因组与转录组两类序列数据。关于样本数量、测序平台、读长、覆盖深度、文件格式与数据体量等具体技术参数,源站未提供。
【采集与来源】
该数据来源于 ega-archive.org,即 EGA(European Genome-phenome Archive)数据归档平台,源站描述说明其由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究产生。数据围绕一名滑膜肉瘤患者采集,采集对象为该患者的肿瘤基因组与转录组序列信息。关于样本采集的具体部位、采集时间、伦理审批信息、知情同意细节以及数据处理流程等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于滑膜肉瘤的分子特征分析,可用于围绕该病例探索基因组与转录组层面的变异信息;也适用于个性化肿瘤基因组研究,作为 POG 研究框架下的患者级序列数据支持个体化肿瘤基因组学的相关分析;同时可用于相关变异探索,为研究者提供来自真实滑膜肉瘤病例的序列数据基础。其肿瘤 / 其他分类属性表明其面向肿瘤研究领域,适合需要以患者为单位开展基因组与转录组联合考察的研究场景。
【使用方法】
该数据托管于 ega-archive.org,属于 EGA 归档资源。关于该数据集的具体获取方式、访问权限申请流程、下载途径、数据格式说明及配套分析工具等,源站未提供。使用者在计划使用前,应依据 EGA 平台的相关规定与源站信息确认访问条件。
【质量与限制】
该数据集为来自单一滑膜肉瘤患者的基因组与转录组序列数据,其覆盖范围限于该患者个体,源站描述未提及其包含多个样本或队列信息。关于数据质量评估指标、测序质量参数、数据完整性说明以及已知技术限制等,源站未提供。使用者在解读与推广相关分析结论时,需考虑其单病例来源这一事实所限定的适用范围。
【引用与许可】
该数据来源于 ega-archive.org,产生于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。关于该数据集的具体引用格式、文献出处、许可协议类型及使用条款等,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前,应查阅源站及 EGA 平台的相关说明以确认引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001015985
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Genome and transcriptome sequence data from a synovial sarcoma patient [Dataset]. https://www.ega-archive.org/datasets/EGAD00001015985
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