复发性唾液腺(肌上皮癌)患者基因组与转录组测序数据
该数据集来自 ega-archive.org,包含一例复发性唾液腺肌上皮癌患者的基因组与转录组测序数据,由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics (POG) 研究产生

基本信息
资源简介
复发性唾液腺(肌上皮癌)患者基因组与转录组测序数据
该数据集收录于一例复发性唾液腺肌上皮癌患者的基因组与转录组测序数据,源站标题为“Genome and transcriptome sequence data from a recurrent salivary gland (myoepithelial carcinoma) patient”,来源站为 ega-archive.org。从标题与源站描述可知,这批数据围绕一名复发性唾液腺肌上皮癌(myoepithelial carcinoma)患者展开,同时涵盖基因组与转录组两个层面的序列信息,并且是在 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究框架下产生的。在本站分类中,该数据集归入“肿瘤 / 其他”类别。整体而言,它属于肿瘤基因组学研究中针对罕见唾液腺肿瘤类型的个案测序数据集合,适合关注肌上皮癌分子特征、复发肿瘤基因组变化以及个体化肿瘤基因组学研究的人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集对应的疾病背景为唾液腺肌上皮癌,且为复发病例。唾液腺肿瘤本身在头颈部肿瘤中相对少见,肌上皮癌作为其中的一种类型,临床与分子层面的公开数据较为有限。该数据产生于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究,这一背景说明其属于以患者个体为对象的肿瘤基因组学研究产出,而非大规模人群队列数据。源站描述明确将该病例标注为“复发性”,因此数据所对应的样本与疾病状态与复发情境相关。除上述信息外,源站未提供关于该患者年龄、性别、治疗史或复发时间等临床细节。
【数据内容】
依据源站标题与描述,该数据集包含两类序列数据:基因组序列数据与转录组序列数据,二者均来自同一例复发性唾液腺肌上皮癌患者。基因组层面可用于考察肿瘤的DNA水平变异,转录组层面则反映RNA表达信息,两者结合构成对该病例的基因组—转录组联合刻画。数据以序列数据形式提供,具体文件格式、样本数量、测序平台、测序深度、覆盖度以及是否包含配对正常样本等信息,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 ega-archive.org,即欧洲基因组—表型档案(EGA)相关资源站点,源站标题与描述均指向同一病例。数据由 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究产生,属于该研究项目框架下的测序产出。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批编号、样本处理流程与测序服务提供方等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于围绕唾液腺肌上皮癌的探索性研究,例如考察复发病例在基因组与转录组层面的特征,或作为罕见唾液腺肿瘤分子背景的参考个案。由于同时具备基因组与转录组数据,也适合用于两类数据之间的对照与整合分析思路验证。此外,对于关注个体化肿瘤基因组学研究实践的人员,该数据可作为了解 POG 研究产出形式的实例。需要说明的是,该数据为单例患者数据,不适用于需要群体统计效力的研究场景;关于其在具体分析任务中的适用性,源站未提供进一步说明。
【使用方法】
该数据集通过 ega-archive.org 获取,使用时应遵循该站点的数据访问流程与相关规定。由于涉及患者来源的基因组与转录组序列数据,通常需要在受控访问机制下申请与使用。具体的下载方式、访问权限层级、数据文件组织方式与分析流程建议,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为单例复发性唾液腺肌上皮癌患者的数据,样本量有限,结论外推需谨慎。关于测序质量指标、数据完整性、是否存在批次效应或技术偏差等信息,源站未提供。此外,临床注释、随访信息与病理细节的完备程度,源站亦未提供,使用者在解释分析结果时应考虑这些信息缺口。
【引用与许可】
该数据的来源站为 ega-archive.org,产生于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。具体的引用格式、数据许可条款、使用限制与再分发规定,源站未提供,使用前应向数据提供方或源站确认。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001015933
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Genome and transcriptome sequence data from a recurrent salivary gland (myoepithelial carcinoma) patient [Dataset]. https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001015933
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