转移性滑膜肉瘤患者的基因组与转录组测序数据

数据覆盖肿瘤基因组和转录组层面,可用于探索滑膜肉瘤转移相关的分子特征、基因变异与表达模式,并支持个性化肿瘤基因组学方向的预测性分析研究(来源 EGA)

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基因组预测None
Genome and transcriptome sequence data from a metastatic synovial sarcoma patient

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

转移性滑膜肉瘤患者的基因组与转录组测序数据

该数据集为来源于 EGA(European Genome-phenome Archive)的肿瘤基因组与转录组序列数据,英文名称为“Genome and transcriptome sequence data from a metastatic synovial sarcoma patient”,本站归类于“肿瘤 / 其他”。数据覆盖一名转移性滑膜肉瘤患者的基因组与转录组两个层面,可用于探索滑膜肉瘤转移相关的分子特征、基因变异与表达模式,并支持个性化肿瘤基因组学方向的预测性分析研究。整体而言,该数据集面向肿瘤基因组学与转录组学交叉研究场景,为理解转移性滑膜肉瘤的分子基础提供了序列层面的数据资源。

【数据集背景】

该数据集来自 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究项目,是该项目产出的一部分。POG 研究以个性化肿瘤基因组学为方向,通过对患者肿瘤样本进行基因组与转录组测序,获取与个体肿瘤相关的分子信息。本数据集对应的对象为一名转移性滑膜肉瘤患者,其英文名称明确指向“转移性滑膜肉瘤患者”的基因组与转录组序列数据。滑膜肉瘤是一种较为少见的软组织肿瘤,转移性病例在临床与研究上均具有较高的关注价值;该数据集正是在这一背景下产生的序列数据资源,服务于肿瘤分子特征与个性化分析相关的研究需求。

【数据内容】

从数据层面看,该数据集同时包含基因组和转录组序列数据。基因组层面可用于考察肿瘤的基因变异情况,转录组层面则可用于考察基因表达模式;两者结合,有助于从变异与表达两个角度刻画转移性滑膜肉瘤的分子特征。数据集的主题标签在来源信息中未给出具体内容,源站未提供更细的标签分类说明。除“基因组与转录组序列数据”这一总体描述外,源站未提供样本数量、测序平台、读长、数据量、文件格式等具体技术参数,因此无法在本介绍中列出更细的数据构成指标。

【采集与来源】

该数据来源于 ega-archive.org,即 EGA 数据归档平台。根据源站描述,这些数据是在 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究框架下生成的,研究对象为一名转移性滑膜肉瘤患者。数据由基因组与转录组测序产生,属于肿瘤基因组学研究产出的序列数据。关于样本采集的具体时间、地点、临床信息、伦理审批细节以及测序实验的具体流程,源站未提供,故此处不作展开。

【适用场景】

结合数据覆盖的基因组与转录组层面,该数据集适用于探索滑膜肉瘤转移相关的分子特征、基因变异与表达模式,并可支持个性化肿瘤基因组学方向的预测性分析研究。具体而言,研究者可围绕转移性滑膜肉瘤的基因变异谱与转录表达谱开展分析,考察变异与表达之间的关联,或将其作为个性化肿瘤基因组学方法探索中的案例数据。需要说明的是,上述适用方向依据数据主题与来源描述归纳,源站未提供针对该数据集的具体分析结论或验证结果。

【使用方法】

该数据集托管于 EGA 平台,属于受控访问的基因组数据归档资源。关于该数据集的具体访问方式、申请流程、使用条件与下载途径,源站未提供详细说明,使用者应以 EGA 平台的相关规定为准。源站亦未提供配套的分析流程、参考基因组版本或数据处理脚本,故本介绍不对使用方法作进一步推测。

【质量与限制】

该数据集为单名转移性滑膜肉瘤患者的基因组与转录组序列数据,其样本规模有限,适用于个案层面的分子特征探索,不宜直接外推为滑膜肉瘤群体的普遍结论。源站未提供数据质量评估指标、测序深度、覆盖度或质控结果等信息,相关质量情况无法在本介绍中说明。此外,数据主题标签未给出具体内容,源站也未提供临床随访、疗效或预后相关信息,使用时应结合研究目的审慎解读。

【引用与许可】

该数据集来源于 ega-archive.org,原始描述指向 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。关于该数据集的正式引用格式、数据许可条款、使用限制与再分发规定,源站未提供,使用者应参照 EGA 平台及数据提供方的相关要求执行。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001004602

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Genome and transcriptome sequence data from a metastatic synovial sarcoma patient [Dataset]. https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001004602

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