平滑肌肉瘤患者的基因组与转录组测序数据
数据覆盖该患者的基因组和转录组序列信息,可用于肿瘤相关研究,例如探索平滑肌肉瘤的分子特征、变异识别以及个性化肿瘤基因组学分析(来源 EGA)

基本信息
资源简介
平滑肌肉瘤患者的基因组与转录组测序数据
该数据集为来源于一名平滑肌肉瘤患者的基因组与转录组序列数据,英文名称为“Genome and transcriptome sequence data from a leiomyosarcoma patient”,在站内归入肿瘤/其他分类,来源站点为 ega-archive.org。根据源站描述,这批数据是作为 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究的一部分产生的。数据覆盖该患者的基因组和转录组序列信息,可用于肿瘤相关研究,例如探索平滑肌肉瘤的分子特征、变异识别以及个性化肿瘤基因组学分析。整体而言,该数据集以单一患者为对象,同时提供基因组与转录组两个层面的序列信息,适合围绕平滑肌肉瘤这一肿瘤类型开展分子层面的探索性研究,并为个性化肿瘤基因组学相关分析提供数据基础。
【数据集背景】
该数据集来自 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。POG 研究以个性化肿瘤基因组学为核心方向,本数据集即为该研究产出的组成部分之一,聚焦于一名平滑肌肉瘤患者。平滑肌肉瘤属于肿瘤范畴,在站内分类中归入“肿瘤 / 其他”。数据集以该患者的基因组和转录组序列数据为内容主体,体现了从个体患者出发、结合基因组与转录组信息开展肿瘤分子特征研究的思路。源站描述明确了数据的产生背景与所属研究项目,但未提供该患者的具体临床信息、研究设计细节或项目整体规模等进一步背景。
【数据内容】
数据内容为该患者的基因组和转录组序列信息。基因组层面与转录组层面的序列数据共同构成该数据集的主体,覆盖范围限于这一名平滑肌肉瘤患者。主题标签方面,源站未提供。除“基因组和转录组序列数据”这一总体描述外,源站未提供关于测序平台、读长类型、数据文件格式、样本数量、数据体量或具体变异位点等更细粒度的信息。
【采集与来源】
数据来源站点为 ega-archive.org。根据源站描述,数据产生于 BC Cancer Agency 的 Personalized OncoGenomics(POG)研究。除上述来源与研究项目信息外,源站未提供样本采集时间、采集机构、处理流程、测序中心或数据提交时间等具体采集信息。
【适用场景】
依据源站描述,该数据可用于肿瘤相关研究,例如探索平滑肌肉瘤的分子特征、变异识别以及个性化肿瘤基因组学分析。由于数据同时涵盖基因组与转录组序列信息,其适用方向集中在以该患者为对象的分子特征刻画与变异层面的探索。源站未提供关于其他具体应用场景、验证用途或临床决策支持的进一步说明。
【使用方法】
源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供。需要说明的是,该数据集仅涉及一名平滑肌肉瘤患者,其覆盖范围限于该个体;除此之外,源站未提供关于数据质量评估、完整性、批次效应或使用限制等方面的信息。
【引用与许可】
源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001002570
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Genome and transcriptome sequence data from a leiomyosarcoma patient [Dataset]. https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001002570
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




