通过STING相分离构建时空巨噬细胞回路以克服胰腺癌免疫抑制

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A1bf46c34ecd881d9ffcbfc75437a22e3ae23b8925076a4a6d762eae056b20eca

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胰腺导管腺癌（PDAC）仍然是最致命的恶性肿瘤之一，这主要归因于其高度免疫抑制的肿瘤微环境（TME），该微环境促进了转移和免疫治疗耐药。通过对单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集的综合分析，我们鉴定出多个异质性肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）亚群是PDAC进展的关键调控者，这些亚群共表达MRC1，并通过主动抑制抗肿瘤免疫应答发挥作用。为克服这一障碍，我们开发了一种时空巨噬细胞重编程平台，利用STING相分离来重编程TAM的可塑性并重塑免疫景观。该系统PMMB将CSF-1R抑制剂和STING激动剂整合于巨噬细胞模拟纳米结构中，实现对TAMs的序贯、可控重编程。通过利用STING相分离，PMMB将TAMs稳定在抗肿瘤CD80⁺表型，同时防止过度in…，小鼠PDAC肿瘤的单细胞RNA测序 为创建皮下异种移植PDAC模型，将5×106个KPC细胞注射到雄性C57BL/6小鼠右侧腹。

分别在第0、3、6、9和12天将PMMB注射到小鼠尾静脉中。第14天，收集小鼠肿瘤用于scRNA-seq。将肿瘤用酶解离成单细胞悬液。去除死细胞后，将活细胞（>80%）重悬于含0.5% BSA的PBS中，并进行scRNA-seq处理。根据制造商的操作方案，使用基于液滴的平台生成单细胞文库，包括逆转录、cDNA扩增和文库索引。文库在Illumina NovaSeq平台上测序，每个细胞产生约200,000条reads，中位检测基因数约为2,000–2,500个。原始reads用fastp（4）过滤，比对到小鼠mm10基因组，并处理生成基因-条形码矩阵，用于Seur中的下游分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。