ESCC与正常组织差异蛋白表达数据集
该数据集来自 omicsdi.org，收录了配对食管鳞状细胞癌（ESCC）与癌旁正常组织的蛋白质表达差异数据。研究采集了 10 对手术切除的 ESCC 及正常组织样本，开展高通量蛋白质组实验，并通过比较分析揭示 ESCC 中失调的信号通路
基本信息
资源简介
ESCC与正常组织差异蛋白表达数据集
该数据集聚焦于配对食管鳞状细胞癌（ESCC）与癌旁正常组织之间的蛋白质表达差异，来源于 omicsdi.org，归类于肿瘤 / 其他方向。研究通过采集 10 对手术切除的 ESCC 及正常组织样本，开展高通量蛋白质组实验，并对配对样本进行比较分析，以揭示 ESCC 中失调的信号通路。数据集以蛋白质表达和 ESCC 为核心主题标签，整体设计围绕同一患者来源的肿瘤组织与邻近正常组织之间的对照展开，适合用于观察肿瘤发生过程中蛋白质层面的变化趋势。其价值在于将配对设计与高通量蛋白质组检测相结合，为理解 ESCC 的分子特征提供数据基础。
【数据集背景】
食管鳞状细胞癌是食管癌的主要组织学类型之一，其发生发展涉及复杂的分子改变。要理解肿瘤与正常组织之间的差异，需要在蛋白质层面开展系统比较。该数据集正是为理解配对食管鳞状细胞癌与癌旁正常组织之间蛋白质表达的差异而建立，研究采集了 10 对手术切除的 ESCC 及正常组织样本，用于高通量蛋白质组实验，并期望通过比较分析揭示 ESCC 中失调的信号通路。
【数据内容】
数据集收录的是配对食管鳞状细胞癌（ESCC）与癌旁正常组织的蛋白质表达差异数据，主题标签为蛋白质表达与 ESCC。其核心内容是围绕 10 对配对样本开展高通量蛋白质组实验后获得的蛋白质表达信息，以及在此基础上进行的比较分析结果。源站描述强调通过比较分析可以揭示 ESCC 中失调的信号通路，因此数据内容指向肿瘤与正常组织之间蛋白质表达差异及其所关联的信号通路变化。除上述范围外，具体蛋白质数量、差异倍数、显著性阈值等细节源站未提供。
【采集与来源】
样本来自手术切除标本，共采集 10 对配对的 ESCC 与正常组织，即同一来源的肿瘤组织与癌旁正常组织成对纳入。数据集来源站为 omicsdi.org，本站分类为肿瘤 / 其他。研究采用高通量蛋白质组实验对上述配对样本进行检测，以获取蛋白质表达层面的数据。关于样本采集的具体时间、地点、入组标准、手术方式及伦理审批等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于食管鳞状细胞癌蛋白质层面的差异表达研究，可用于比较配对肿瘤组织与癌旁正常组织之间的蛋白质表达变化，并在此基础上关注 ESCC 中可能失调的信号通路。其配对设计有助于在个体内进行肿瘤与正常组织的对照观察，适合作为 ESCC 分子机制探索、候选蛋白筛选及信号通路分析的参考数据。关于该数据集在其他疾病、其他组学层面或临床决策中的具体应用，源站未提供。
【使用方法】
使用时可围绕 10 对配对样本的蛋白质表达差异展开比较分析，重点关注 ESCC 与癌旁正常组织之间的表达变化，并结合源站描述所指向的失调信号通路进行解读。由于数据集强调配对设计，分析时应保持肿瘤与正常组织的配对关系。关于数据文件格式、下载方式、预处理流程、分析软件及具体统计方法，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 10 对手术切除的 ESCC 及正常组织样本，样本量有限，使用时应考虑这一规模对结果稳定性的影响。数据聚焦于蛋白质表达差异及信号通路层面，未涵盖其他组学或临床信息。关于样本质量评估、实验重复次数、缺失值情况、批次效应及验证实验等信息，源站未提供。
【引用与许可】
数据集来源站为 omicsdi.org。关于引用方式、许可协议、使用条款及数据再分发规定，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD019834
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为理解配对食管鳞状细胞癌（ESCC）与癌旁正常组织之间蛋白质表达的差异，我们收集了10对手术切除标本中的ESCC及正常组织，用于高通量蛋白质组学实验。通过比较分析，可揭示ESCC中失调的信号通路。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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