CT-LEFAT 标准评估头颈淋巴水肿观察者可靠性与诊断准确性数据集

该数据集为头颈癌治疗后淋巴水肿 CT-LEFAT 定性评估研究提供匿名化 NIfTI 影像及配套临床数据,包含 75 个文件,涵盖多名肿瘤科医师对左右前/后颈间隙、颈前中线及颏下中线等解剖部位的重复判读结果,以及淋巴水肿诊断阳性/阴性标注

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2024-11-20 更新
浏览 6
医学影像分类Medical physicsRadiation therapyHead and neck cancerLymphedemaFibrosisHead and neck imaging
Dataset for "Evaluating Observer Reliability and Diagnostic Accuracy of CT-LEFAT Criteria for Post-Treatment Head and Neck Lymphedema: A Prospective Blinded Comparative Analysis of Oncologist Human Inter-Rater Performance"

基本信息

模态
医学影像
大小
5.770512954 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-11-20
版本
v1

资源简介

CT-LEFAT 标准评估头颈淋巴水肿观察者可靠性与诊断准确性数据集

Dataset for "Evaluating Observer Reliability and Diagnostic Accuracy of CT-LEFAT Criteria for Post-Treatment Head and Neck Lymphedema: A Prospective Blinded Comparative Analysis of Oncologist Human Inter-Rater Performance"

该数据集为头颈癌治疗后淋巴水肿 CT-LEFAT 定性评估研究提供匿名化 NIfTI 影像及配套临床数据,包含 75 个文件,涵盖多名肿瘤科医师对左右前/后颈间隙、颈前中线及颏下中线等解剖部位的重复判读结果,以及淋巴水肿诊断阳性/阴性标注。数据可用于评估观察者间与观察者内可靠性、诊断准确性,并支持影像判读一致性分析(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

项目资助方:Development of functional magnetic resonance imaging-guided adaptive radiotherapy for head and neck cancer patients using novel MR-Linac device。源站首次发布:2024-11-20。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):用于开发和撰写题为“Evaluating Observer Reliability and Diagnostic Accuracy of CT-LEFAT Criteria for Post-Treatment Head and Neck Lymphedema: A Prospective Blinded Comparative Analysis of Oncologist Human Inter-Rater Performance”手稿的匿名化 NIfTI 数据集。该数据集包含在 CT-LEFAT 定性审查过程中呈现给评审者的匿名化 NIfTI(.nii)图像。clinical_val_anon:该 CSV 文件包含从纳入 CT-LEFAT 审查的患者中提取的匿名化/去标识化数据。数据包括:匿名受试者 ID、重复、读者、时间点、解剖位置(右/左前颈间隙、右/左后颈间隙、颈前中线及颏下中线间隙(N/A 表示未收到回复))、淋巴水肿(HNL)诊断(1=阳性,0=阴性)、图像中是否存在淋巴水肿(

【数据结构与技术规格】

文件数 75 个,合计 5.77 GB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.27040849.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Radiology and organ imaging、Radiation therapy、Medical physics。主题标签:Medical physics、Radiation therapy、Head and neck cancer、Lymphedema、Fibrosis、Head and neck imaging。本站分类:肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Radiology and organ imaging、Radiation therapy、Medical physics。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Dataset_for_Evaluating_Observer_Reliability_and_Diagnostic_Accuracy_of_CT-LEFAT_Criteria_for_Post-Treatment_Head_and_Neck_Lymphedema_A_Prospective_Blinded_Comparative_Analysis_of_Oncologist_Human_Inter-Rater_Performance_/27040849

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:West, Natalie; Kamel, Serageldin; Kaffey, Zaphanlene; Dede, Cem; Mulder, Samuel; El-Habashy, Dina M.; et al. (2024). Dataset for "Evaluating Observer Reliability and Diagnostic Accuracy of CT-LEFAT Criteria for Post-Treatment Head and Neck Lymphedema: A Prospective Blinded Comparative Analysis of On…

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源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.27040849.v1

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 5.77 GB。

数据说明

用于手稿《评估CT-LEFAT标准对治疗后头颈部淋巴水肿的观察者可靠性和诊断准确性:肿瘤科医生人间评分者表现的前瞻性盲法比较分析》的开发与分析中的匿名NIfTI数据集。该数据集包含在CT-LEFAT定性审查过程中呈现给评审者的匿名NIfTI(.nii)图像。clinical_val_anon:此CSV文件包含从纳入CT-LEFAT审查的患者中提取的匿名/去标识化数据。

数据包括:匿名受试者ID、重复、阅片者、时间点、解剖位置(右/左颈前间隙、右/左颈后间隙、颈前中线及颏下中线间隙(N/A表示未收到响应))、淋巴水肿(HNL)诊断(1=阳性,0=阴性)、图像中是否存在淋巴水肿(1=是,0=否)、影像与诊断之间的时间差(月)(无HNL诊断时使用N/A),以及使用MD Anderson癌症中心淋巴水肿分级量表进行的淋巴水肿诊断(依据Smith等,doi:10.1097/MOO.0b013e3283393799,其中1=阳性,0=阴性,N/A=无法评估)。阅片者间信度:此CSV文件包含阅片者间信度Fleiss’ kappa方法的统计数据。数据包括:ROI、时间点、kappa值、kappa值的解释、平均kappa值。阅片者内信度:此CSV文件包含阅片者内Fleiss’ kappa方法的统计数据。数据包括:ROI、评分者、精确kappa、按ROI的平均kappa、按阅片者的平均kappa、总体平均kappa。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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