塔斯马尼亚袋獾可传染性癌症快速进化响应数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.r60sv

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 270.1 MB。

数据说明

尽管癌症很少表现为传染性疾病，但塔斯马尼亚袋獾（Sarcophilus harrisii）中最近出现的一种传染性癌症几乎100%致命。袋獾面部肿瘤病（DFTD）已席卷该物种几乎整个分布区，在不到20年内导致局部种群下降超过90%，整体物种数量减少逾80%。尽管流行病学模型预测该物种将灭绝，但在长期受疾病影响的地区，种群依然存续。在此，我们报告了罕见的基因组证据，表明野生动物疾病施加的强烈选择压力下，宿主发生了快速、平行的进化响应。我们识别出两个基因组区域，其中包含与人类免疫功能或癌症风险相关的基因，在三个种群中表现出一致的选择特征。DFTD通过抑制和逃避宿主免疫系统在宿主间传播，我们的结果表明，宿主正在进化出免疫调节的抗性，这可能有助于该物种在面对这一毁灭性疾病时得以存续。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。