结肠癌细胞中microRNA-143下调Hexokinase 2的数据
数据基于微阵列转录谱分析,物种为Homo sapiens,用于研究miR-143在结肠癌中的靶标。源站描述显示,通过微阵列方法鉴定miR-143靶标,发现miRNA结合位点在miRNA过表达后下调转录本的3'UTR中显著富集,并确定Hexokinase 2(HK2)为miR-143的直接靶标,在结肠

基本信息
资源简介
结肠癌细胞中microRNA-143下调Hexokinase 2的数据
microRNA-143 downregulates Hexokinase 2 in colon cancer cells
该数据集来自ebi.ac.uk,标题为microRNA-143 downregulates Hexokinase 2 in colon cancer cells,属于肿瘤/其他分类。数据基于微阵列转录谱分析,物种为Homo sapiens,用于研究miR-143在结肠癌中的靶标。源站描述显示,通过微阵列方法鉴定miR-143靶标,发现miRNA结合位点在miRNA过表达后下调转录本的3'UTR中显著富集,并确定Hexokinase 2(HK2)为miR-143的直接靶标,在结肠癌细胞系DLD-1中重新引入miR-143导致乳酸分泌减少,表明miR-143下调HK2影响葡萄糖代谢。数据可用于miRNA靶标鉴定及结肠癌代谢研究(来源 B。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):MicroRNAs(miRNAs)已成为重要的基因调控因子,并被认为是肿瘤发生中的关键角色。据报道,miR-143在多种癌症中下调,但其在结肠癌中的靶标知识仍然有限。为了研究miR-143在结肠癌中的作用,我们采用基于微阵列的方法来鉴定miR-143靶标。基于种子位点富集分析和无偏词分析,我们发现miRNA过表达后下调转录本的3'非翻译区(UTR)中miRNA结合位点显著富集。在此,我们确定Hexokinase 2(HK2)为miR-143的直接靶标,并显示在结肠癌细胞系DLD-1中重新引入miR-143导致乳酸分泌减少,表明miR-143下调HK2影响结肠癌细胞中的葡萄糖代谢。DLD-1细胞被转染
【主题与分类】
主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类:肿瘤/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-33420
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- OpenDataLab:
数据说明
Lea Gregersen; L Gregersen; A Jacobsen; L Frankel; J Wen; A Krogh; A Lund (2012). microRNA-143 downregulates Hexokinase 2 in colon cancer cells [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-33420
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