横纹肌肉瘤microRNA深度测序数据
该数据集来自ebi.ac.uk，利用深度测序技术检测了685个microRNA在肺泡型横纹肌肉瘤、胚胎型横纹肌肉瘤及正常骨骼肌中的表达谱
基本信息
资源简介
横纹肌肉瘤microRNA深度测序数据
Deep Sequencing the microRNA profile in rhabdomyosarcoma reveals down-regulation of miR-378 family members
该数据集来自ebi.ac.uk，利用深度测序技术检测了685个microRNA在肺泡型横纹肌肉瘤、胚胎型横纹肌肉瘤及正常骨骼肌中的表达谱。研究发现97个microRNA在肿瘤与正常组织间显著失调，miR-378家族成员在肿瘤组织和细胞系中明显下调，并预测IGF1R为其潜在靶点。数据可用于横纹肌肉瘤miRNA标志物筛选、靶基因预测及分型相关研究（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：横纹肌肉瘤（RMS）是一种高度恶性的肿瘤，占儿童软组织肉瘤的近一半。已有报道显示包括RMS在内的人类癌症中存在miRNA水平改变。利用深度测序技术，在一组肺泡型RMS（ARMS）、胚胎型RMS（ERMS）以及正常骨骼肌（NSM）中研究了总共685个miRNA。生物信息学流程用于miRNA靶标预测和聚类分析。与NSM相比，ARMS和ERMS中有97个miRNA显著失调。miR-378家族成员在RMS肿瘤组织和细胞系中急剧减少。有趣的是，miR-378家族成员呈现为可能的靶标——胰岛素样生长因子受体1（IGF1R），这是RMS中的关键信号分子。
【主题与分类】
主题标签：Homo sapiens。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-3246
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- OpenDataLab:
数据说明
Alessandro Guffanti; Francesca Megiorni (2015). Deep Sequencing the microRNA profile in rhabdomyosarcoma reveals down-regulation of miR-378 family members [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-3246
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