结直肠癌空间转录组与单细胞RNA测序数据集
该数据集来自 zenodo.org，包含结直肠癌（CRC）空间转录组与单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）数据，共 4 个文件，提供元数据、计数矩阵以及 barcode 和基因文件
基本信息
资源简介
结直肠癌空间转录组与单细胞RNA测序数据集
Colorectal cancer spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing dataset
该数据集来自 zenodo.org，包含结直肠癌（CRC）空间转录组与单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）数据，共 4 个文件，提供元数据、计数矩阵以及 barcode 和基因文件。元数据包含批次、样本来源、细胞空间中心坐标，以及原始发表和 Crescendo 发表的两套细胞类型标签。数据可用于细胞类型分类、空间位置分析及单细胞与空间转录组整合研究（来源 Zenodo，cc-by-4.0 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2025-01-05。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：用于结直肠癌（CRC）空间转录组与 scRNA-seq 数据集的元数据和计数矩阵（同时提供 barcode 和基因文件），该数据集用于 Millard 等人于 2025 年发表的 Crescendo 手稿。Batch 列指示细胞来自 scRNA-seq 数据还是哪个空间转录组切片。sample_id 列指示细胞所属样本。center_x 和 center_y 列指示细胞在空间中的中心（scRNA-seq 细胞在这些列中为 0）。orig_publication_type 指示来自 CRC scRNA-seq 数据集原始发表的细粒度细胞类型标签，而 cresc_publication_type 列指示来自 Crescendo 发表的更粗粒度细胞类型标签。
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个，合计 132.04 MB。数据集 DOI：10.5281/zenodo.14602110。
【主题与分类】
主题标签：结直肠癌、空间转录组、单细胞RNA测序、细胞类型注释、肿瘤。本站分类：肿瘤/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/14602110
使用许可：cc-by-4.0。
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
curl -L -o "CRC_scRNAseq-spatial_barcodes.csv" "https://zenodo.org/api/records/14602110/files/CRC_scRNAseq-spatial_barcodes.csv/content"
curl -L -o "CRC_scRNAseq-spatial_meta_data.csv" "https://zenodo.org/api/records/14602110/files/CRC_scRNAseq-spatial_meta_data.csv/content"
curl -L -o "CRC_scRNAseq-spatial_genes.csv" "https://zenodo.org/api/records/14602110/files/CRC_scRNAseq-spatial_genes.csv/content"
curl -L -o "CRC_scRNAseq-spatial_counts.mtx" "https://zenodo.org/api/records/14602110/files/CRC_scRNAseq-spatial_counts.mtx/content"
文件清单
CRC_scRNAseq-spatial_barcodes.csv（5.5 MB）CRC_scRNAseq-spatial_meta_data.csv（21.1 MB）CRC_scRNAseq-spatial_genes.csv（0.0 MB）CRC_scRNAseq-spatial_counts.mtx（99.2 MB）
数据集大小约 132.0 MB。
数据说明
用于Millard等人（2025）发表的Crescrendo手稿的结直肠癌（CRC）空间转录组学和scRNA-seq数据集的元数据和计数矩阵（同时提供条形码和基因文件）。Batch列指示细胞来自scRNA-seq数据还是哪个空间转录组学切片。sample_id列指示细胞来自哪个样本。center_x和center_y列指示细胞在空间中的中心位置（scRNA-seq细胞的这些列值为0）。orig_publication_type指示CRC scRNA-seq数据集原始发表中的细粒度细胞类型标签，而cresc_publication_type列指示Crescendo发表中更粗粒度的细胞类型标签。
许可
cc-by-4.0
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