cBioPortal:肉瘤(TCGA,PanCancer Atlas)

源站描述指出这是肉瘤 TCGA PanCancer 数据,并提供了原始数据与相关出版物的链接。数据可围绕肉瘤的基因组与临床特征开展分析,适用于肿瘤分类、预后预测等研究场景(来源 cBioPortal)

cbioportal
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基因组分类soft_tissue
cBioPortal: Sarcoma (TCGA, PanCancer Atlas)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

cBioPortal:肉瘤(TCGA,PanCancer Atlas)

cBioPortal 上的 Sarcoma (TCGA, PanCancer Atlas) 数据集是肿瘤研究领域中一个聚焦于肉瘤的公开数据资源。该数据集归属于肿瘤 / 其他分类,主题标签为 soft_tissue,来源于 cbioportal.org。根据源站描述,这是肉瘤 TCGA PanCancer 数据,源站同时提供了原始数据与相关出版物的链接。数据集围绕肉瘤的基因组与临床特征,可用于肿瘤分类、预后预测等研究场景。整体而言,该数据集为研究者提供了一个可探索肉瘤分子特征与临床信息的基础资源,适合在癌症基因组学与临床转化研究中使用。

【数据集背景】

该数据集的英文名称为 cBioPortal: Sarcoma (TCGA, PanCancer Atlas),源站标题为 Sarcoma (TCGA, PanCancer Atlas)。它属于 TCGA PanCancer Atlas 计划中针对肉瘤的部分。源站描述指出,这是肉瘤 TCGA PanCancer 数据,并给出了原始数据与相关出版物的链接。数据集在本站被归类为肿瘤 / 其他,主题标签为 soft_tissue,表明其关注的是软组织肉瘤相关方向。该数据集的出现,为肉瘤这一相对少见但异质性较强的肿瘤类型提供了集中化的数据入口,便于研究者从 PanCancer 的视角开展比较与分析。

【数据内容】

源站描述仅说明这是肉瘤 TCGA PanCancer 数据,并提供了原始数据与相关出版物的链接。关于具体的样本数量、组学层面(如突变、拷贝数、表达等)、临床字段、随访信息等详细内容,源站未提供。主题标签为 soft_tissue,提示数据与软组织肉瘤相关。整体上,该数据集可围绕肉瘤的基因组与临床特征开展分析,但具体包含哪些数据表或变量,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 cbioportal.org,源站标题为 Sarcoma (TCGA, PanCancer Atlas)。源站描述提到原始数据在此处,相关出版物在此处,但未进一步说明样本采集地点、采集时间、纳入排除标准或处理流程。数据与 TCGA PanCancer Atlas 相关,其 DOI 字段列出了多个 PMID:29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、32214244、296。关于采集与来源的更具体信息,源站未提供。

【适用场景】

根据源站描述,该数据可围绕肉瘤的基因组与临床特征开展分析,适用于肿瘤分类、预后预测等研究场景。主题标签为 soft_tissue,因此适合软组织肉瘤相关的分子特征探索、亚型划分、临床关联分析等方向。研究者可将其用于 PanCancer 框架下的跨癌种比较,或聚焦于肉瘤内部的异质性研究。其他具体应用场景,源站未提供。

【使用方法】

源站描述提供了原始数据与相关出版物的链接,用户可通过 cbioportal.org 访问该数据集。关于具体的数据下载方式、分析工具、接口或操作步骤,源站未提供。使用者可参考源站给出的出版物链接了解数据背景,但详细的使用指南源站未提供。

【质量与限制】

源站描述仅说明这是肉瘤 TCGA PanCancer 数据,并提供了原始数据与相关出版物的链接。关于数据质量评估、缺失情况、批次效应、样本量限制或使用注意事项,源站未提供。该数据集归类为肿瘤 / 其他,主题标签为 soft_tissue,但具体的质量与限制信息源站未提供。

【引用与许可】

该数据集列出了多个 PMID:29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、32214244、296。源站描述提到相关出版物在此处,但未说明具体的引用格式或许可条款。关于许可类型、使用限制或授权要求,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=sarc_tcga_pan_can_atlas_2018

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Sarcoma TCGA PanCancer data. The original data is here . The publications are here .

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