cBioPortal:嗜铬细胞瘤与副神经节瘤(TCGA,Cell 2017)

该数据集来自 cBioPortal,收录 TCGA 于 2017 年发表于 Cell 的嗜铬细胞瘤与副神经节瘤研究,包含 178 对肿瘤/正常样本的全外显子测序数据

cbioportal
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基因组分类soft_tissue
cBioPortal: Pheochromocytoma and Paraganglioma (TCGA, Cell 2017)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

cBioPortal:嗜铬细胞瘤与副神经节瘤(TCGA,Cell 2017)

cBioPortal 收录的 Pheochromocytoma and Paraganglioma (TCGA, Cell 2017) 数据集,对应嗜铬细胞瘤与副神经节瘤研究,来源于 cbioportal.org,主题标签为 soft_tissue,在本站归类于肿瘤 / 其他。该数据集的核心内容是 TCGA 于 2017 年发表于 Cell 的研究成果,包含 178 对肿瘤/正常样本的全外显子测序数据,相关文献可通过 pmid:28162975 检索。整体而言,这是一个面向嗜铬细胞瘤与副神经节瘤的肿瘤基因组数据集,可用于了解该研究在 cBioPortal 平台上的数据组织方式与访问入口。

【数据集背景】

该数据集对应 TCGA 于 2017 年发表在 Cell 上的嗜铬细胞瘤与副神经节瘤研究。嗜铬细胞瘤与副神经节瘤属于与软组织相关的肿瘤类型,数据集的英文名称为 cBioPortal: Pheochromocytoma and Paraganglioma (TCGA, Cell 2017),源站标题为 Pheochromocytoma and Paraganglioma (TCGA, Cell 2017)。数据集通过 cbioportal.org 提供,主题标签为 soft_tissue,在本站分类中归入肿瘤 / 其他。该研究的文献标识为 pmid:28162975,可作为追溯研究背景与发表信息的依据。

【数据内容】

该数据集收录的是全外显子测序数据,样本规模为 178 对肿瘤/正常配对样本。源站描述明确指出,这是 178 例嗜铬细胞瘤或副神经节瘤的肿瘤/正常配对全外显子测序。除上述样本数量与测序类型外,源站未提供更多关于具体基因、突变谱、临床注释或衍生分析结果的细节。

【采集与来源】

数据来源站为 cbioportal.org,数据集标题与源站标题一致,均为 Pheochromocytoma and Paraganglioma (TCGA, Cell 2017)。该数据集与 TCGA 于 2017 年发表于 Cell 的研究相对应,文献标识为 pmid:28162975。除来源站、标题与文献标识外,源站未提供关于样本采集地点、采集时间、伦理审批或具体测序平台的更多信息。

【适用场景】

该数据集适用于围绕嗜铬细胞瘤与副神经节瘤的全外显子测序数据开展探索性分析,例如在 cBioPortal 平台上浏览该研究的肿瘤/正常配对样本信息。由于主题标签为 soft_tissue,也可用于与软组织相关肿瘤数据集的对照或检索。除上述基于来源与样本类型的通用用途外,源站未提供关于具体分析场景、研究问题或应用方向的说明。

【使用方法】

该数据集通过 cbioportal.org 提供访问,用户可在该平台上检索标题 Pheochromocytoma and Paraganglioma (TCGA, Cell 2017) 或英文名称 cBioPortal: Pheochromocytoma and Paraganglioma (TCGA, Cell 2017) 以定位数据集。关于数据下载格式、接口调用方式、可视化操作步骤或分析工具的具体使用方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集包含 178 对肿瘤/正常样本的全外显子测序数据,样本规模与测序类型在源站描述中有明确说明。除此之外,源站未提供关于数据完整性、质控标准、批次效应、覆盖深度或已知偏差等质量与限制方面的信息。

【引用与许可】

该数据集对应 TCGA 于 2017 年发表于 Cell 的嗜铬细胞瘤与副神经节瘤研究,文献标识为 pmid:28162975。关于该数据集的具体引用格式、许可条款或使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=pcpg_tcga_pub

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Whole exome sequencing of 178 Pheochromocytoma or Paraganglioma tumor/normal pairs.

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