cBioPortal:多形性胶质母细胞瘤(TCGA,PanCancer Atlas)

它汇集了 TCGA PanCancer 项目中多形性胶质母细胞瘤的相关数据,原始数据与相关出版物可通过源站链接获取。该数据可用于肿瘤基因组学分析、分子分型及癌症相关研究,具体样本量、测序平台与临床字段等细节源站未提供(来源 cBioPortal)

cbioportal
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基因组分类difg
cBioPortal: Glioblastoma Multiforme (TCGA, PanCancer Atlas)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

cBioPortal:多形性胶质母细胞瘤(TCGA,PanCancer Atlas)

cBioPortal 上的 Glioblastoma Multiforme (TCGA, PanCancer Atlas) 数据集,汇集了 TCGA PanCancer 项目中与多形性胶质母细胞瘤相关的数据。该数据集归属于肿瘤 / 其他类别,来源站为 cbioportal.org,主题标签为 difg。原始数据与相关出版物均可通过源站提供的链接获取。该数据可用于肿瘤基因组学分析、分子分型及癌症相关研究,但具体样本量、测序平台与临床字段等细节源站未提供。

【数据集背景】

多形性胶质母细胞瘤是中枢神经系统常见的恶性肿瘤之一,在肿瘤基因组学研究中具有重要地位。TCGA PanCancer Atlas 项目旨在对多种癌症类型进行统一的分析与整合,以支持跨癌种的比较研究。该数据集正是这一项目框架下针对多形性胶质母细胞瘤所整理的数据集合,其英文名称为 cBioPortal: Glioblastoma Multiforme (TCGA, PanCancer Atlas),源站标题为 Glioblastoma Multiforme (TCGA, PanCancer Atlas)。数据集在 cBioPortal 平台上发布,便于研究者访问和探索。

【数据内容】

该数据集汇集了 TCGA PanCancer 项目中多形性胶质母细胞瘤的相关数据。源站描述指出,这是多形性胶质母细胞瘤的 TCGA PanCancer 数据,原始数据与相关出版物均提供了链接入口。数据集的主题标签为 difg。关于具体的分子数据类型、样本数量、临床信息字段、测序平台等详细内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 cbioportal.org,属于 TCGA PanCancer Atlas 项目的一部分。源站描述中明确提到原始数据可在指定位置获取,相关出版物也有对应链接。数据集的 DOI 信息以 pmid 形式列出,包括 pmid:29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、30643250、322 等。除上述来源信息外,关于样本采集方式、数据处理流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

根据源站描述,该数据可用于肿瘤基因组学分析、分子分型及癌症相关研究。作为 TCGA PanCancer Atlas 项目中的多形性胶质母细胞瘤数据集合,它适合用于探索该肿瘤类型的分子特征,也可在跨癌种研究背景下作为比较分析的一部分。具体的研究应用方向需结合源站提供的原始数据与出版物进一步确定,源站未提供更详细的适用场景说明。

【使用方法】

该数据集可通过 cbioportal.org 访问。源站描述中提供了原始数据与相关出版物的链接,用户可据此获取数据并查阅配套文献。关于数据下载格式、分析工具、接口调用方式等具体操作细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 cBioPortal 平台上的 TCGA PanCancer Atlas 项目,其原始数据与出版物均有明确指向。然而,关于数据质量评估指标、版本信息、更新频率、样本量、测序平台与临床字段等具体细节,源站未提供。使用者应结合源站链接中的原始数据与出版物自行评估数据的适用性与局限性。

【引用与许可】

该数据集的相关出版物信息以 pmid 形式列出,包括 pmid:29625048、29596782、29622463、29617662、29625055、29625050、29617662、30643250、322 等。引用时应参考这些出版物以及源站提供的原始数据链接。关于数据使用的具体许可条款与授权要求,源站未提供。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=gbm_tcga_pan_can_atlas_2018

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Glioblastoma Multiforme TCGA PanCancer data. The original data is here . The publications are here .

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