cBioPortal:成人软组织肉瘤(TCGA,Cell 2017)

其可确认的核心内容是 206 例成人软组织肉瘤肿瘤/正常配对的全外显子测序,关联文献标识为 pmid:29100075。标题中还包含 TCGA 和 Cell 2017 字样,短描述与标题一致

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基因组分类soft_tissue
cBioPortal: Adult Soft Tissue Sarcomas (TCGA, Cell 2017)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-05

资源简介

cBioPortal:成人软组织肉瘤(TCGA,Cell 2017)

成人软组织肉瘤(TCGA, Cell 2017)是发布在 cbioportal.org 的一个肿瘤相关数据资源,英文名称为 cBioPortal: Adult Soft Tissue Sarcomas (TCGA, Cell 2017)。它在来源站标题为 Adult Soft Tissue Sarcomas (TCGA, Cell 2017),被归入“肿瘤 / 其他”类别,主题方向标记为 soft_tissue。其可确认的核心内容是 206 例成人软组织肉瘤肿瘤/正常配对的全外显子测序,关联文献标识为 pmid:29100075。标题中还包含 TCGA 和 Cell 2017 字样,短描述与标题一致。

【数据集背景】

该资源在来源站上的标题为 Adult Soft Tissue Sarcomas (TCGA, Cell 2017),英文名称带有 cBioPortal 前缀。从名称和分类看,它面向成人软组织肉瘤这一肿瘤类型,并在来源站中被置于肿瘤 / 其他类别之下,主题方向标记为 soft_tissue。标题中的 TCGA 和 Cell 2017 提供了命名和文献关联线索,但关于该数据集更详细的研究背景、科学问题、样本选择依据、项目组织方式等,源站未提供。来源站为 cbioportal.org,属于癌症基因组数据门户;该数据集是其中一个面向成人软组织肉瘤的资源条目。

【数据内容】

根据来源站说明,该数据集包含对 206 例成人软组织肉瘤肿瘤/正常配对进行的全外显子测序,英文原文描述为 Whole-exome sequencing of 206 Adult Soft Tissue Sarcoma tumor/normal pairs.。因此,可确认的数据内容包括肿瘤样本与正常样本配对的全外显子测序信息,样本数量为 206 对。除此之外,是否还包含突变列表、拷贝数变异、表达谱、临床随访、生存信息、病理亚型、治疗信息或其他组学数据,源站未提供。其短描述与标题一致,主题方向标记为 soft_tissue,分类为肿瘤 / 其他。

【采集与来源】

该数据集的来源站是 cbioportal.org。它在来源站上的标题为 Adult Soft Tissue Sarcomas (TCGA, Cell 2017),英文名称为 cBioPortal: Adult Soft Tissue Sarcomas (TCGA, Cell 2017)。来源站描述指出,该资源涉及 206 例成人软组织肉瘤肿瘤/正常配对的全外显子测序。关联文献标识为 pmid:29100075。标题中的 TCGA 和 Cell 2017 提供了与相关项目及文献年份的命名关联,但具体采集机构、伦理审批、样本来源地、采集时间范围、数据版本和更新历史等,源站未提供。

【适用场景】

基于可确认信息,该数据集可用于成人软组织肉瘤肿瘤/正常配对全外显子测序数据的检索、浏览和探索,也可作为肿瘤基因组学研究中围绕软组织肉瘤的二次分析入口。由于分类为肿瘤 / 其他,主题方向为 soft_tissue,它适合在软组织肿瘤相关数据检索场景中被关注。对于是否适合特定分析、推荐统计方法、临床解释或诊断用途,源站未提供说明。任何具体应用都需要结合来源站功能、原始文献和后续分析设计来判断。

【使用方法】

该数据集发布在 cbioportal.org。访问和使用应通过该来源站进行;在来源站内可使用标题 Adult Soft Tissue Sarcomas (TCGA, Cell 2017) 或英文名称 cBioPortal: Adult Soft Tissue Sarcomas (TCGA, Cell 2017) 进行定位。关于站内检索、在线浏览、数据下载、接口调用、分析工具、账号权限等具体操作方式,源站未提供。若需要复用数据,应先在来源站确认相关指引和可用功能。

【质量与限制】

可确认的数据特征是 206 例成人软组织肉瘤肿瘤/正常配对的全外显子测序。关于测序深度、覆盖均匀性、质控标准、样本排除规则、批次效应、数据版本、更新日期、完整性、临床注释质量等,源站未提供。全外显子测序通常覆盖外显子及相关区域,解读时一般需要关注捕获范围、覆盖深度和样本质量等因素;就本数据集而言,这些具体指标未提供。其分类“肿瘤 / 其他”和主题方向 soft_tissue 较为宽泛,使用时需注意适用边界。

【引用与许可】

可确认的关联文献标识为 pmid:29100075,来源站标题为 Adult Soft Tissue Sarcomas (TCGA, Cell 2017),英文名称为 cBioPortal: Adult Soft Tissue Sarcomas (TCGA, Cell 2017)。引用时应以来源站或原始文献给出的引用格式为准。关于许可协议、使用限制、商业用途、再分发条件、署名要求等,源站未提供。使用前应核对来源站及原始文献中的相关声明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=sarc_tcga_pub

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

206例成人软组织肉瘤肿瘤/正常配对样本的全外显子组测序。

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