口腔癌颈部淋巴结清扫患者组织样本中的生物标志物
该数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦头颈癌中的口腔鳞状细胞癌(OSCC)。数据为接受颈部淋巴结清扫术患者的组织样本,通过 PCR 筛查人乳头瘤病毒,并利用 microarray 分析量化目标基因表达水平,以识别淋巴结转移特征

基本信息
资源简介
口腔癌颈部淋巴结清扫患者组织样本中的生物标志物
该数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦头颈癌中的口腔鳞状细胞癌(OSCC)。数据为接受颈部淋巴结清扫术患者的组织样本,通过 PCR 筛查人乳头瘤病毒,并利用 microarray 分析量化目标基因表达水平,以识别淋巴结转移特征。数据可用于验证淋巴结阳性 OSCC 特征对淋巴结状态的预测能力,并支持基于前哨淋巴结活检原发灶的淋巴结预测研究(来源 clinicaltrials.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):疾病:头颈癌。目标: 使用一组 OSCC 肿瘤队列,检验淋巴结阳性口腔鳞状细胞癌(OSCC)特征预测淋巴结阳性原发灶的初步数据。 使用前哨淋巴结活检的原发灶进行淋巴结预测。* 验证初步的淋巴结阳性 OSCC 特征并检验其预测淋巴结状态的能力。概要:患者组织样本使用聚合酶链反应(PCR)针对人乳头瘤病毒特异性引物进行筛查。分析样本以识别口腔鳞状细胞癌的淋巴结转移特征。样本还进行 microarray 分析以量化目标基因的表达水平。初始数据分析使用 Affymetrix® Microarray Suite 5.0 进行,以量化目标基因的表达水平。
【主题与分类】
主题标签:Head and Neck Cancer。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://clinicaltrials.gov/study/NCT00899704
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
疾病:头颈部癌症。目的:* 使用一组口腔鳞状细胞癌(OSCC)肿瘤队列,检验来自淋巴结阳性OSCC特征谱的初步数据预测淋巴结阳性原发灶的能力。* 使用前哨淋巴结活检的原发灶进行淋巴结预测。* 验证初步的淋巴结阳性OSCC特征谱数据,并测试其预测淋巴结状态的能力。大纲:使用聚合酶链反应(PCR)以人乳头瘤病毒特异性引物对患者组织样本进行筛查。对样本进行分析,以确定口腔鳞状细胞癌的淋巴结转移特征谱。样本还进行微阵列分析,以定量目标基因的表达水平。使用Affymetrix® Microarray Suite 5.0进行初步数据分析,以定量目标基因的表达水平。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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