头颈癌患者与健康志愿者生物标志物研究

该数据集来自 clinicaltrials.gov,研究对象为头颈部鳞状细胞癌患者与健康志愿者,计划各入组 50 人。研究采集血液、组织和唾液样本,通过液相色谱串联质谱、ELISA、蛋白质组学分析和蛋白表达检测,分析白蛋白结合与非白蛋白结合蛋白或 IgG

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clinicaltrials
浏览 2
蛋白质预测Head and Neck Cancer
Biomarkers in Patients With Head and Neck Cancer and in Healthy Volunteers

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

头颈癌患者与健康志愿者生物标志物研究

该数据集英文名为 Biomarkers in Patients With Head and Neck Cancer and in Healthy Volunteers,来源于 clinicaltrials.gov,本站归类为肿瘤 / 其他,主题标签为 Head and Neck Cancer。研究对象为头颈部鳞状细胞癌患者与健康志愿者,计划各入组 50 人,合计 100 人。研究为前瞻性设计,采集参与者的血液、组织和唾液样本用于生物学研究,并采用液相色谱串联质谱(LC-MS-MS)、ELISA、蛋白质组学分析和蛋白表达检测等手段,分析白蛋白结合与非白蛋白结合蛋白或 IgG。研究的核心目标是比较患者与健康志愿者之间血清蛋白谱差异与肽段匹配数量差异的关联,以及蛋白水平与血清中肽段匹配最大差异之间的关联。

【数据集背景】

该数据集对应的研究聚焦头颈部肿瘤中的头颈部鳞状细胞癌。研究的基本设想是比较头颈部鳞状细胞癌患者与健康志愿者在血清蛋白谱上的差异,并将这种差异与肽段匹配数量的差异联系起来;同时进一步考察蛋白水平与血清中肽段匹配最大差异之间的关联。通过患者与健康志愿者的对照设计,研究试图从蛋白质层面刻画两类人群的生物学差别。该研究为前瞻性研究,计划入组 50 名患者和 50 名健康志愿者。

【数据内容】

数据集围绕生物学样本的检测结果组织。参与者接受血液、组织和唾液采集,样本用于生物学研究。检测分析对象包括白蛋白结合蛋白与非白蛋白结合蛋白,以及 IgG。所采用的分析技术包括液相色谱串联质谱(LC-MS-MS)、ELISA、蛋白质组学分析和蛋白表达检测。数据内容的核心指向血清蛋白谱、肽段匹配数量、蛋白水平以及蛋白表达等信息。除上述样本类型与检测项目外,源站未提供更细的字段级数据说明。

【采集与来源】

数据来自 clinicaltrials.gov 登记的研究。采集方式为前瞻性研究框架下的生物样本采集,样本类型为血液、组织和唾液。样本采集后进入生物学研究流程,接受液相色谱串联质谱、ELISA、蛋白质组学分析和蛋白表达等检测。研究计划入组总量为 50 名患者与 50 名健康志愿者。源站未提供具体的采集时间点、采集机构、样本处理与保存流程等信息。

【适用场景】

该数据集适用于与头颈部鳞状细胞癌生物标志物相关的探索性研究场景,例如比较患者与健康志愿者血清蛋白谱差异、考察肽段匹配数量差异与蛋白谱差异的关联、分析蛋白水平与肽段匹配最大差异之间的关系,以及涉及白蛋白结合与非白蛋白结合蛋白或 IgG 的蛋白质组学与蛋白表达分析。也可用于方法学层面参考液相色谱串联质谱、ELISA 与蛋白质组学分析在头颈部肿瘤生物样本研究中的组合应用。源站未提供该数据集在其他具体应用场景中的用途说明。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据获取方式、文件格式、字段定义、分析流程与统计方法等均未说明。已知的分析技术路线为液相色谱串联质谱、ELISA、蛋白质组学分析和蛋白表达检测,但源站未提供相应的操作细节或数据处理规范。

【质量与限制】

该研究为计划入组 50 名患者和 50 名健康志愿者的前瞻性研究,样本规模有限。源站未提供样本质量评估、数据完整性、缺失值处理、偏倚控制或验证结果等信息。由于源站未提供字段级说明与数据发布形式,数据集的实际可用范围与质量水平无法依据现有信息判断。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可条款信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT00899769

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:头颈部癌症。目的:* 将头颈部鳞状细胞癌患者与健康志愿者血清蛋白谱的差异与肽匹配数量的差异进行关联。* 将这些参与者血清中肽匹配差异最大的蛋白质水平进行关联。概要:这是一项前瞻性研究。参与者需提供血液、组织和唾液样本用于生物学研究。样本将通过液相色谱-串联质谱(LC-MS-MS)、ELISA、蛋白质组学分析和蛋白质表达分析,检测白蛋白结合型和非白蛋白结合型蛋白或IgG。预计招募人数:本研究计划招募50名患者和50名健康志愿者。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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