MSKCC肉瘤临床基因组测序数据集
由纪念斯隆-凯特琳癌症中心(MSKCC)提供的肉瘤靶向下一代测序数据集,其中包含数十例黏液纤维肉瘤的突变图谱、拷贝数改变及患者临床预后信息。由Memorial Sloan Kettering Cancer Center提供,来自cBioPortal,数据格式为表格,包含212条数据记录,适用于分类任务,许可证为CC BY-NC 4.0。

基本信息
资源简介
由纪念斯隆-凯特琳癌症中心(MSKCC)提供的肉瘤靶向下一代测序数据集,其中包含数十例黏液纤维肉瘤的突变图谱、拷贝数改变及患者临床预后信息。
下载信息
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.cbioportal.org/study/summary?id=sarc_mskcc_2022
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 0.05 GB。
数据说明
由纪念斯隆-凯特琳癌症中心(MSKCC)提供的肉瘤靶向下一代测序数据集,其中包含数十例黏液纤维肉瘤的突变图谱、拷贝数改变及患者临床预后信息。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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