染色体碎裂是高危骨髓增生异常综合征中的一种复发性基因组异常
该数据集包含301例骨髓增生异常综合征(MDS)及MDS/骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者的基因组数据,涵盖基于阵列的比较基因组杂交(aCGH)检测的DNA拷贝数异常和下一代测序(NGS)获得的DNMT3A、TET2、RUNX1、TP53、BCOR等基因突变信息,数据模态为基因拷贝数变异和序列突变。其主要用途是研究高危MDS患者中染色体碎裂等复发性基因组异常的特征,探索隐性缺失与基因突变的关系,为血液肿瘤的分子机制研究和临床风险分层提供基因组学依据。
https://figshare.com/articles/dataset/Chromothripsis_Is_a_Recurrent_Genomic_Abnormality_in_High-Risk_Myelodysplastic_Syndromes/4035531
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资源简介
该数据集旨在通过整合基于阵列的比较基因组杂交(aCGH)和下一代测序(NGS)技术,探索骨髓增生异常综合征(MDS)及MDS/骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者中发生的新型遗传异常。研究纳入了301例初诊MDS(n=240)或MDS/MPN(n=61)患者,进行了全基因组DNA拷贝数异常分析,并对部分病例的DNMT3A、TET2、RUNX1、TP53和BCOR基因进行了NGS突变分析。结果发现,71例患者(23.6%)中存在285种异常,其中3例高危MDS(1.2%)表现出涉及13号染色体的染色体碎裂现象,影响了FLT3、BRCA2和RB1等癌症基因,且所有病例均携带TP53突变。此外,整合aCGH与NGS分析揭示了2p23.3(DNMT3A)、4q24(TET2)、17p13(TP53)、21q22(RUNX1)和Xp11.4(BCOR)区域的隐性复发性缺失。该数据集为研究MDS的基因组异常、染色体碎裂机制及高危患者的分子标志物提供了重要数据支持,主要应用于癌症基因组学、血液肿瘤研究和精准医疗方向。
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