全基因组测序发现家族性骨髓瘤风险基因

该数据集以病例集合的形式出现,主题指向通过全基因组测序发现家族性骨髓瘤风险基因。关于该研究的具体立项背景、研究假设、家系收集策略、目标人群、病例与对照设计、招募时间与地区、协作单位、资助来源和伦理审批等信息,源站未提供

dbgap
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基因组分类Case Set
phs001819: Whole Genome Sequencing to Discover Familial Myeloma Risk Genes

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

全基因组测序发现家族性骨髓瘤风险基因

phs001819 是一个来自 NCBI 的 dbGaP 研究数据集,英文题名为 Whole Genome Sequencing to Discover Familial Myeloma Risk Genes,在本站被归入肿瘤/其他分类,相关标签为 Case Set。该数据集以病例集合的形式出现,主题指向通过全基因组测序发现家族性骨髓瘤风险基因。

【数据集背景】

该数据集的名称为 Whole Genome Sequencing to Discover Familial Myeloma Risk Genes,提示其研究目标与家族性骨髓瘤的风险基因发现有关。源站说明其为 dbGaP study (Case Set)。关于该研究的具体立项背景、研究假设、家系收集策略、目标人群、病例与对照设计、招募时间与地区、协作单位、资助来源和伦理审批等信息,源站未提供。全基因组测序在肿瘤遗传研究中通常用于系统性地发现胚系或体细胞变异,家族性肿瘤研究也可能关注遗传易感位点与家系聚集现象;这些仅为相关领域的一般性说明,不能替代对该数据集具体背景的说明。

【数据内容】

源站未提供该数据集的具体数据内容,包括但不限于样本数量、测序平台、读长、覆盖深度、参考基因组版本、变异检出流程、文件格式、临床表型变量、家系结构、随访信息以及是否包含对照样本等。可以确认的是,该研究以全基因组测序为手段,目标与发现家族性骨髓瘤风险基因有关,并且被标记为 Case Set。超出这些范围的具体数据组成,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,源站说明为 dbGaP study (Case Set)。关于样本采集地点、采集机构、知情同意方式、样本处理与测序执行单位、数据提交者、数据版本历史以及质控流程等信息,源站未提供。就来源而言,可确认其与 NCBI 的 dbGaP 研究体系相关,并采用病例集合的形式呈现。

【适用场景】

源站未提供该数据集的具体适用场景。基于现有信息,只能确认它与全基因组测序和家族性骨髓瘤风险基因发现这一主题相关,并被归为肿瘤/其他类别、带有 Case Set 标签。至于是否可用于遗传关联分析、风险预测、家系连锁分析、变异注释比较、方法学基准测试或临床转化研究等,源站未提供明确说明,因此不应自行推断。

【使用方法】

源站未提供该数据集的访问地址、申请条件、下载方式、授权流程、推荐分析工具、参考流程、数据格式说明或使用文档。对于受控访问的基因组数据,使用通常需要遵循来源数据库的访问政策和数据使用条件;但该数据集具体应如何申请、是否开放、是否需要审批以及使用范围如何界定,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量指标与限制说明,包括样本质量、测序质量、覆盖均匀性、污染控制、重复样本、群体分层、批次效应、缺失数据比例、验证实验和版本更新等。全基因组测序数据在分析中通常可能受到覆盖度、变异注释、样本量、家系结构和人群代表性等因素影响,但这些属于一般性技术考量,并不代表该数据集已经披露了相应的具体质量信息。关于其自身质量与限制,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可条款、数据使用协议、出版要求、联系人信息或致谢模板。可确认的是,该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,源站说明为 dbGaP study (Case Set)。在未获得更具体说明前,任何引用或许可使用都应回到来源站点核实相关政策和要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001819

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case Set).

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