MCC样本来源MCPyV序列与参考JN707599的变异比较数据集

该数据集以表格形式记录了默克尔细胞癌样本中默克尔细胞多瘤病毒基因组序列与参考序列的变异比较结果,包含大规模重排、缺失以及小片段插入缺失和单核苷酸多态性等基因模态数据,主要用于研究病毒在肿瘤中的基因组变异特征、整合机制及其在癌症发生发展过程中的演化规律。

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2020-08-24 更新
病毒基因组变异默克尔细胞多瘤病毒
创建时间2020-08-24
更新时间2020-08-24
原始链接

https://figshare.com/articles/dataset/Variants_in_MCC_sample_derived_MCPyV_sequences_compared_to_reference_JN707599_obtained_by_capture_sequencing_/12857135

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资源简介

该数据集记录了通过捕获测序技术获得的默克尔细胞癌(MCC)样本中默克尔细胞多瘤病毒(MCPyV)序列与参考序列JN707599的变异比较结果。数据集包含两个主要部分:上半部分展示较大规模的重排和缺失变异,下半部分记录小片段插入缺失(indels)以及单核苷酸多态性(SNPs)。数据中蓝色字段表示在超过99%的读数中出现的变异,橙色字段表示仅出现在部分读数中的变异。该数据集以XLSX格式存储,主要用于研究MCPyV病毒在默克尔细胞癌中的基因组变异特征、病毒整合机制以及肿瘤发生发展过程中的病毒演化规律。

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影像Variants in MCC sample derived MCPyV sequences compared to reference JN707599 obtained by capture sequencing