维莫非尼耐药与亲本BRAF V600E小鼠黑色素瘤细胞（5555与5555R）的转录组分析
BioProject 汇集与单一计划相关的生物数据，可来自单一组织或联盟，并为用户提供查找该项目产生的不同类型数据的统一入口
基本信息
资源简介
维莫非尼耐药与亲本BRAF V600E小鼠黑色素瘤细胞（5555与5555R）的转录组分析
Transcriptomic profiling of vemurafenib-resistant ... (ID 1534932) - BioProject - NCBI
该记录为 NCBI BioProject（ID 1534932），标题涉及 vemurafenib 耐药相关的转录组分析。BioProject 汇集与单一计划相关的生物数据，可来自单一组织或联盟，并为用户提供查找该项目产生的不同类型数据的统一入口。该记录标签为“Transcriptome or Gene expression”（来源 NCBI）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：BioProject 是与单一研究计划相关的一组生物学数据，源自单一机构或一个联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口，以便找到指向该项目所生成的各种数据类型的链接。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptome or Gene expression。本站分类：肿瘤/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1534932
下载信息
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数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1534932
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对BRAF抑制剂（BRAFi）的耐药限制了BRAF突变型黑色素瘤的长期临床获益。为表征获得性BRAFi耐药相关的肿瘤内在转录变化，我们对BRAF V600E小鼠黑色素瘤细胞系5555及其维莫非尼耐药衍生株5555R进行了bulk RNA-seq；5555R由本实验室通过长期暴露于维莫非尼而建立。与亲本细胞相比，耐药细胞表现出炎症和干扰素应答、细胞骨架/肌动球蛋白、机械力感知以及上皮-间质转化程序的富集。这些数据与一项研究相配套，该研究显示，BRAFi耐药黑色素瘤细胞重新激活肌动球蛋白收缩性，并呈现分泌表型改变伴M-CSF增加，从而促进单核细胞向免疫抑制性肿瘤相关巨噬细胞分化。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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