黑色素瘤肺部微转移数据集
该数据集包含通过PhysiCell模拟生成的计算生物学数据，主要模态为细胞级仿真数据，用于研究黑色素瘤在肺部微转移过程中的细胞扩散、生长及其与微环境的相互作用，适用于癌症转移机制分析和多尺度肿瘤建模等研究方向。
基本信息
资源简介
黑色素瘤肺部微转移数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《PhysiCell Multiscale Immune Surveillance Dataset for Micrometastases》。源站首次发布：2024-02-03。
【数据内容】
源站原始描述：An ensemble of PhysiCell simulations of a multiscale model of immune surveillance in micrometastases. Computational model and data analysis are available at Attention: In this dataset, when interpreting cell annotations, replace ''lung cells'' with ''parenchyma cells''. It''s important to note that this modification does not impact the analysis results. Originally, the dataset was based on an initial hypothesis suggesting a focus on lung tissue, but the current interpretation categorizes it as genera…
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个，合计 1.67 GB。Clust_UMAP_15_01_2.pickle：application/octet-stream，3.40 MB。Patient_UMAP_15_01_2.pickle：application/octet-stream，211.03 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.21514116.v5。
【主题与分类】
源站学科分类：Systems biology。主题标签：PhysiCell、Multiscale model、Cancer patient''s digital twin、Micrometastasis。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Systems biology。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Lung_melanoma_micrometastasis_dataset/21514116
使用许可：MIT（https://opensource.org/licenses/MIT）。
规范引用：L Rocha, Heber (2022). PhysiCell Multiscale Immune Surveillance Dataset for Micrometastases. figshare. Dataset
下载信息
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暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（Figshare）
源站：https://figshare.com/articles/dataset/Lung_melanoma_micrometastasis_dataset/21514116/2
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个多尺度模型下黑色素瘤在肺部微转移的PhysiCell模拟集合，包含通过计算模型生成的仿真数据，用于研究黑色素瘤细胞在肺组织微环境中的扩散与生长机制。数据来源于基于PhysiCell平台构建的计算机模拟，并提供了相应的数据分析和模型代码（可通过GitHub获取）。主要应用于计算生物学、癌症转移机制研究以及肿瘤微环境的多尺度建模等领域。
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