IDR idr0026-Weigelin免疫治疗(实验A)

源站将其描述为 Image Data Resource 中经过整理的细胞/组织成像研究,归属 OME/EMBL-EBI。数据集名称中包含 immunotherapy,提示其主题与免疫治疗有关;但关于研究背景、疾病模型、治疗方式、实验假设、研究机构、作者团队、发表信息等,源站未提供

idr
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医学影像分类显微成像组织切片荧光标记肿瘤免疫肿瘤微环境免疫应答图像分析细胞表型
IDR idr0026-weigelin-immunotherapy (experimentA)

基本信息

模态
医学影像
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

IDR idr0026-Weigelin免疫治疗(实验A)

IDR idr0026-weigelin-immunotherapy (experimentA) 是一个来自 idr.openmicroscopy.org 的细胞/组织成像数据集,属于 Image Data Resource(OME/EMBL-EBI)中经过整理的成像研究,实验标识为 experimentA,包含 18 幅图像,在本站被归入肿瘤 / 其他类别。

【数据集背景】

该数据集对应 IDR study idr0026-weigelin-immunotherapy,实验部分为 experimentA。源站将其描述为 Image Data Resource 中经过整理的细胞/组织成像研究,归属 OME/EMBL-EBI。数据集名称中包含 immunotherapy,提示其主题与免疫治疗有关;但关于研究背景、疾病模型、治疗方式、实验假设、研究机构、作者团队、发表信息等,源站未提供。在本站中,该数据集被归入肿瘤 / 其他类别,说明其被置于肿瘤相关方向下的其他子类中。除此之外,更详细的背景信息源站未提供。

【数据内容】

该实验包含 18 幅图像。这些图像属于细胞/组织成像研究数据,并以 OME/EMBL-EBI 的 Image Data Resource 作为整理与发布环境。数据集名称中的 immunotherapy 提示与免疫治疗主题相关,且其在本站被归入肿瘤 / 其他类别,因此可理解为肿瘤相关或其他相关方向下的成像内容。但每幅图像的具体内容、组织类型、细胞类型、成像目标、通道数量、荧光标记、分辨率、像素尺寸、时间序列长度、视野大小、实验条件、分组信息等,源站未提供。数据集中是否包含原始图像、处理图像、元数据附件、分析结果或派生数据,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 idr.openmicroscopy.org。源站描述表明,该数据是 IDR study idr0026-weigelin-immunotherapy 的 experimentA,属于 Image Data Resource 中经过整理的细胞/组织成像研究,相关基础设施或归档归属为 OME/EMBL-EBI。除来源站和上述描述外,采集仪器、显微镜型号、物镜、检测器、采集参数、染色方案、样本制备流程、伦理审批、数据提交者、提交时间、更新记录等,源站未提供。

【适用场景】

基于其被整理为细胞/组织成像研究,该数据集可用于查看细胞或组织层面的成像资料,也可作为肿瘤 / 其他类别下与免疫治疗主题相关的影像数据资源进行浏览与参考。由于数据集包含 18 幅图像,并来自 IDR 这一整理型成像资源,潜在用途包括影像数据检索、展示、方法学参考及后续分析中的对照或复用等通用场景。不过,关于该数据集是否适用于特定研究问题、能否支持免疫治疗疗效评估、能否用于算法训练或验证、是否适合临床决策等,源站未提供,因此不应超出已有描述进行推断。

【使用方法】

可通过来源站 idr.openmicroscopy.org 访问 IDR study idr0026-weigelin-immunotherapy 的 experimentA。该实验在 IDR 中作为细胞/组织成像研究的一部分发布,并归属 OME/EMBL-EBI 相关资源体系。具体使用方式,例如直接下载、在线浏览、图像查看器、API 接口、批量获取、元数据导出、数据格式转换、是否需要登录或申请权限等,源站未提供。若需使用,应以来源站实际提供的访问入口和说明为准。

【质量与限制】

该数据集来自 Image Data Resource,属于经过整理的细胞/组织成像研究,来源为 OME/EMBL-EBI 相关资源。实验 experimentA 包含 18 幅图像。除这些信息外,关于图像质量、分辨率是否满足特定分析、信噪比、覆盖度、重复次数、样本量、缺失情况、批次效应、注释完整度、元数据规范程度、是否有质控报告等,源站未提供。其在本站被归入肿瘤 / 其他类别,仅表示分类归属,不构成对数据质量、研究结论或临床适用性的评价。使用时应结合源站说明自行判断。

【引用与许可】

该数据集称为 IDR idr0026-weigelin-immunotherapy (experimentA),来源站为 idr.openmicroscopy.org,源站描述其为 IDR study idr0026-weigelin-immunotherapy 的 experimentA,属于 Image Data Resource 中经过整理的细胞/组织成像研究,归属 OME/EMBL-EBI。关于引用格式、推荐引文、作者列表、发表论文、DOI、许可协议、使用条款、二次分发规定、商业使用限制等,源站未提供。需要引用或使用该数据时,应查阅来源站给出的正式说明,并以来源站信息为准。

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使用方式

数据集获取

源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-301

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDR 研究 idr0026-weigelin-immunotherapy。实验:experimentA。图像:18。Image Data Resource:经人工整理的细胞/组织成像研究(OME/EMBL-EBI)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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