定量DIA-MS揭示SMARCA4敲低对Group 3髓母细胞瘤的功能影响
该数据集是一个基于定量质谱（DIA-MS）的蛋白质组学数据集，主要包含在MYC扩增的Group 3髓母细胞瘤细胞模型（HD-MB03）中敲低SMARCA4基因后产生的蛋白质表达变化数据，数据模态为蛋白质组学质谱数据。它系统地揭示了SMARCA4缺失导致的染色质复合物失调、细胞周期抑制以及脂质代谢重编程等关键生物学过程，为深入理解Group 3髓母细胞瘤的发病机制、发现新的生物标志物和潜在治疗靶点提供了重要的数据资源，主要应用于肿瘤蛋白质组学、功能研究和转化医学等领域。
基本信息
资源简介
该数据集是一个蛋白质组学数据集，旨在研究SMARCA4基因缺失在侵袭性Group 3髓母细胞瘤（一种儿童脑肿瘤）中的功能影响。数据通过使用强力霉素诱导的shRNA在HD-MB03细胞（MYC扩增的Group 3髓母细胞瘤模型）中实现SMARCA4敲低，并应用定量质谱技术（特别是数据非依赖性采集质谱，DIA-MS）分析由此产生的蛋白质组变化。数据集揭示了SMARCA4缺失导致的多重生物学过程改变，包括SWI/SNF复合物亚基失调、组蛋白上调、PRMT5破坏染色质结构，以及细胞周期、纺锤体组织、DNA复制/修复和氨基酸分解代谢的抑制。研究还发现了显著的脂质代谢重编程，如类固醇生物合成、脂肪酸生物合成等途径的富集。关键候选蛋白（如SMARCA2、CRABP2等）的过表达在独立验证集中得到确认。该数据集为理解Group 3髓母细胞瘤的发病机制提供了蛋白质组层面的见解，并突出了潜在的治疗靶点，适用于肿瘤生物学、功能基因组学和精准医疗等研究方向。
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数据说明
该数据集是一个蛋白质组学数据集，旨在研究SMARCA4基因缺失在侵袭性Group 3髓母细胞瘤（一种儿童脑肿瘤）中的功能影响。数据通过使用强力霉素诱导的shRNA在HD-MB03细胞（MYC扩增的Group 3髓母细胞瘤模型）中实现SMARCA4敲低，并应用定量质谱技术（特别是数据非依赖性采集质谱，DIA-MS）分析由此产生的蛋白质组变化。数据集揭示了SMARCA4缺失导致的多重生物学过程改变，包括SWI/SNF复合物亚基失调、组蛋白上调、PRMT5破坏染色质结构，以及细胞周期、纺锤体组织、DNA复制/修复和氨基酸分解代谢的抑制。研究还发现了显著的脂质代谢重编程，如类固醇生物合成、脂肪酸生物合成等途径的富集。关键候选蛋白（如SMARCA2、CRABP2等）的过表达在独立验证集中得到确认。该数据集为理解Group 3髓母细胞瘤的发病机制提供了蛋白质组层面的见解，并突出了潜在的治疗靶点，适用于肿瘤生物学、功能基因组学和精准医疗等研究方向。
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