MPNST基因组图谱数据集
GeM Consortium 构建的 MPNST 多组学数据集，包含肿瘤和胚系全基因组测序、正常神经与肿瘤转录组数据。由Genomics of MPNST Consortium提供，来自European Genome-phenome Archive，包含多种数据模态，包含332条数据记录，适用于分类任务，专注于肿瘤领域的恶性周围神经鞘膜瘤（MPNST）研究。
基本信息
资源简介
MPNST基因组图谱数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genomics of Malignant Peripheral Nerve Sheath Tumor (MPNST)》。
【数据内容】
源站原始描述：The Genomics of MPNST (GeM) Consortium dataset includes de-identified whole genome sequencing data (.bam) for germline samples (DNA primarily derived from blood) sequenced at standard (30x) coverage (n=88) and for tumor samples (DNA derived from fresh frozen tissue) sequenced at 90x coverage (n=105). This dataset also includes transcriptome profiling data (.fastq) for paired normal nerve samples (n=7) and for tumor samples (n=132)
【主题与分类】
主题标签：None。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面：https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001008608
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001008608
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
GeM Consortium 构建的 MPNST 多组学数据集，包含肿瘤和胚系全基因组测序、正常神经与肿瘤转录组数据。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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