弥漫大B细胞淋巴瘤虚拟组织数据集

该数据集包含弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,通过TissueResolver算法生成虚拟组织表达谱,数据模态涉及基因表达矩阵和临床相关分子信息,主要用于肿瘤微环境解析、细胞类型特异性基因表达计算以及淋巴瘤生物学机制与治疗靶点研究。

Zenodo
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2024-01-25 更新
创建时间2023-11-23
更新时间2024-01-25
原始链接

https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10139154

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资源简介

该数据集是用于生成弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)虚拟组织的RNA表达数据集。它整合了单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据,并通过TissueResolver算法将批量数据转换为虚拟组织表达谱,同时保留了单细胞水平的分子完整性。数据来源包括Schmitz等人(2018)的批量RNA-seq数据,以及Roider等人(2020)和Steen等人(2021)的单细胞数据集,这些数据经过特征选择和TMM标准化处理。该数据集主要用于肿瘤微环境研究、细胞类型特异性基因表达分析以及计算生物学方法验证,为淋巴瘤的分子机制探索和精准医疗提供支持。

提供机构:Zenodo

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影像Virtual Tissues of DLBCL Lymphomas