弥漫性大B细胞淋巴瘤虚拟组织数据集

该数据集整合了弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,通过TissueResolver算法生成虚拟组织表达谱,包含基因表达模态和细胞类型特异性表达值,主要用于肿瘤微环境分析、细胞异质性研究和淋巴瘤分子机制探索等生物信息学与医学研究方向。

Zenodo
Zenodo
2024-01-25 更新
淋巴瘤单细胞转录组RNA-seq数据整合
创建时间2023-11-23
更新时间2024-01-25
原始链接

https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10139153

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资源简介

该数据集是一个基于TissueResolver工具构建的虚拟组织表达数据集,主要针对弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)。数据集整合了来自多个来源的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据,并通过TissueResolver算法将批量数据转化为虚拟组织表达谱,同时保留了单细胞数据的分子完整性。数据来源包括Schmitz等人(2018)的批量RNA-seq数据,以及Roider等人(2020)和Steen等人(2021)的单细胞RNA-seq数据(来自EGA和GEO数据库)。数据集经过特征选择和TMM归一化处理,包含计算得到的细胞类型特异性基因表达值。主要应用于肿瘤微环境分析、细胞异质性研究、淋巴瘤分子机制探索以及生物信息学方法验证等领域。

提供机构:Zenodo

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影像Virtual Tissues of DLBCL lymphomas