人皮肤B细胞淋巴瘤、蕈样肉芽肿(MF)及3例正常皮肤活检组织的转录谱分析
主题标签:肿瘤、淋巴瘤、皮肤活检、转录谱、蕈样肉芽肿、B细胞淋巴瘤。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。本数据集为肿瘤领域的基因组公开数据集,来源:google_dataset,主题涵盖肿瘤。

基本信息
资源简介
人皮肤B细胞淋巴瘤、蕈样肉芽肿(MF)及3例正常皮肤活检组织的转录谱分析
该数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤,聚焦于人类皮肤活检样本的转录谱研究。其英文名称为“Transcription profiling of human cutaneous B-cell lymphoma skin punch biopsies, mycosis fungoides (MF) and 3 normal skin biopsies”,从名称可以看出,研究对象包括皮肤B细胞淋巴瘤的皮肤穿刺活检样本、蕈样肉芽肿(MF)样本以及3例正常皮肤活检样本。数据集在分类上归属于肿瘤 / 淋巴瘤,来源站为ebi.ac.uk。整体而言,该数据集围绕皮肤淋巴瘤及相关皮肤病变的基因表达转录谱展开,为肿瘤特别是淋巴瘤领域的研究提供了公开可用的数据资源,主题标签包括肿瘤、淋巴瘤、皮肤活检、转录谱、蕈样肉芽肿、B细胞淋巴瘤。
【数据集背景】
该数据集来源于ebi.ac.uk,其源站描述中记录了作者信息与发布年份:Janos Demeter; Monique Vanoli-Storz (2005)。数据集标题明确指向人类皮肤B细胞淋巴瘤皮肤穿刺活检、蕈样肉芽肿(MF)以及3例正常皮肤活检的转录谱分析。从分类来看,它属于肿瘤 / 淋巴瘤领域,说明其研究背景与皮肤淋巴瘤的分子特征探索相关。皮肤淋巴瘤是一类涉及皮肤组织的淋巴系统肿瘤,其中蕈样肉芽肿是较为常见的皮肤T细胞淋巴瘤类型,而皮肤B细胞淋巴瘤则属于B细胞来源的淋巴增殖性疾病。该数据集将肿瘤样本与正常皮肤样本并列,可能用于比较病变与正常组织之间的转录谱差异。源站未提供更详细的研究背景、实验假设或项目资助信息。
【数据内容】
数据集的核心内容是转录谱数据,涉及人类皮肤穿刺活检样本。根据标题,样本类型包括:皮肤B细胞淋巴瘤的皮肤穿刺活检样本、蕈样肉芽肿(MF)样本,以及3例正常皮肤活检样本。转录谱通常反映基因表达水平,可用于分析不同样本之间基因表达的差异。该数据集的主题标签包括肿瘤、淋巴瘤、皮肤活检、转录谱、蕈样肉芽肿、B细胞淋巴瘤,进一步概括了其内容范围。除上述信息外,源站未提供样本数量、基因数量、平台类型、数据文件格式等具体细节。
【采集与来源】
该数据集来自ebi.ac.uk,源站描述中给出的引用信息为:Janos Demeter; Monique Vanoli-Storz (2005). Transcription profiling of human cutaneous B-cell lymphoma skin punch biopsies, mycosis fungoides (MF) and 3 normal skin biopsies [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-SMDB-1798。由此可知,数据由Janos Demeter和Monique Vanoli-Storz于2005年发布,并通过EBI的ArrayExpress平台公开。样本采集方式为皮肤穿刺活检,涉及皮肤B细胞淋巴瘤、蕈样肉芽肿及正常皮肤三类。源站未提供具体的采集地点、伦理审批信息、样本处理流程或实验操作细节。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤学、淋巴瘤研究、皮肤疾病分子机制探索等方向。具体而言,可用于比较皮肤B细胞淋巴瘤、蕈样肉芽肿与正常皮肤组织之间的转录谱差异,辅助识别与疾病相关的基因表达特征;也可用于方法学层面的转录谱数据分析练习、生物信息学流程验证或作为公共数据资源进行二次分析。由于数据集包含正常皮肤活检样本,还可用于对照比较研究。源站未提供该数据集在特定研究中的具体应用案例或已验证的分析结论。
【使用方法】
使用者可通过源站提供的链接访问该数据集。源站未提供具体的数据下载格式、预处理步骤、标准化方法或分析工具建议。因此,使用时应参考源站页面上的说明与相关文档。源站未提供使用该数据集所需的具体软件环境、代码示例或分析流程。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、样本量、技术重复、批次效应或数据完整性的具体说明。该数据集仅包含3例正常皮肤活检样本,样本数量有限,可能影响统计效力与结论的普适性。此外,源站未提供平台信息、数据归一化方法或质控指标,使用者在解释结果时需谨慎。源站未提供该数据集的已知限制或偏差说明。
【引用与许可】
引用该数据集时,应使用源站描述中给出的引用格式:Janos Demeter; Monique Vanoli-Storz (2005). Transcription profiling of human cutaneous B-cell lymphoma skin punch biopsies, mycosis fungoides (MF) and 3 normal skin biopsies [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-SMDB-1798。源站未提供许可信息、使用条款或数据共享协议的具体内容,使用前应查阅源站页面以确认相关要求。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-SMDB-1798
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Janos Demeter; Monique Vanoli-Storz (2005). Transcription profiling of human cutaneous B-cell lymphoma skin punch biopsies, mycosis fungoides (MF) and 3 normal skin biopsies [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-SMDB-1798
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