PRJNA559087：体外M-CSF/GM-CSF/CM-WSU-FSCCL处理人巨噬细胞的RNAseq
该数据集来自NCBI，包含12个人巨噬细胞样本的RNA-seq数据，采用核糖体去除的总RNA分析长非编码RNA和编码转录本表达谱
基本信息
资源简介
PRJNA559087：体外M-CSF/GM-CSF/CM-WSU-FSCCL处理人巨噬细胞的RNAseq
该数据集来自NCBI，包含12个人巨噬细胞样本的RNA-seq数据，采用核糖体去除的总RNA分析长非编码RNA和编码转录本表达谱。样本为外周血正常单核细胞经体外处理获得的巨噬细胞亚型，包括M-CSF诱导的M2、GM-CSF诱导的M1以及条件培养基诱导的TAM。数据可用于比较不同巨噬细胞亚型的转录组差异，研究长非编码RNA与编码基因表达特征，并支持肿瘤相关巨噬细胞相关分类分析（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：使用核糖体去除的总RNA对12个人巨噬细胞样本进行RNAseq分析，以分析长非编码RNA和编码转录本表达谱，比较源自外周血正常单核细胞的巨噬细胞体外亚型（M2、M1和TAM）。总体设计：数据集包括来自外周血正常单核细胞获得的巨噬细胞体外亚型的核糖体去除总RNA的RNA-seq数据（每个样本四个Fastq文件，因为进行了配对末端测序，每个样本包括两个重复以将总reads数增加到100M），以分析其长非编码RNA和编码转录本表达谱。样本元数据涉及对不同单核细胞样本进行的体外处理，以获得感兴趣的巨噬细胞亚型：使用M-CSF的M2（N=3），使用GM-CSF的M1（N=6），使用来自
【主题与分类】
主题标签：Transcriptome or Gene expression。本站分类：肿瘤/淋巴瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA559087
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA559087
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
采用核糖体去除的总RNA对12份人类巨噬细胞样本进行RNAseq分析，以分析长非编码RNA和编码转录本的表达谱，比较源自外周血正常单核细胞的体外巨噬细胞亚型（M2、M1和TAM）。总体设计：数据集包含来自外周血正常单核细胞获得的体外巨噬细胞亚型的核糖体去除总RNA的RNA-seq数据（由于采用双端测序，每个样本有四个Fastq文件，且每个样本包含两个重复以将总reads数增加至100M），用于分析其长非编码RNA和编码转录本表达谱。样本元数据涉及对不同单核细胞样本进行的体外处理以获得目标巨噬细胞亚型：使用M-CSF获得M2（N=3），使用GM-CSF获得M1（N=6），使用滤泡性淋巴瘤细胞系WSU-FSCCL的条件培养基获得TAM（N=3）。
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